我在一个.ipynb文件中有一些代码,并且我已经不需要IPython Notebook的“交互”特性了。我想直接从Mac终端命令行运行它。
基本上,如果这只是一个.py文件,我相信我可以从命令行执行python filename.py。对于.ipynb文件是否也有类似的东西?
我在一个.ipynb文件中有一些代码,并且我已经不需要IPython Notebook的“交互”特性了。我想直接从Mac终端命令行运行它。
基本上,如果这只是一个.py文件,我相信我可以从命令行执行python filename.py。对于.ipynb文件是否也有类似的东西?
在命令行中,你可以使用以下命令将笔记本转换为python:
jupyter nbconvert --to python nb.ipynb
https://github.com/jupyter/nbconvert
你可能需要安装python mistune包:
sudo pip install -U mistune
Nbconvert允许你使用——execute标志运行笔记本:
jupyter nbconvert --execute <notebook>
如果你想运行一个笔记本并生成一个新的笔记本,你可以添加——到笔记本:
jupyter nbconvert --execute --to notebook <notebook>
或者如果你想用新的输出替换现有的笔记本:
jupyter nbconvert --execute --to notebook --inplace <notebook>
因为这是一个非常长的命令,你可以使用别名:
alias nbx="jupyter nbconvert --execute --to notebook"
nbx [--inplace] <notebook>
更新引用作者的评论,以获得更好的可视性:
作者注:“这个项目开始于Jupyter的执行API之前,这是现在从命令行运行笔记本的推荐方式。考虑runipy已弃用且无法维护。”——塞巴斯蒂安·帕尔马
安装允许在终端上运行代码的runipy库
pip install runipy
编译代码后:
runipy <YourNotebookName>.ipynb
你也可以试试cronjob。所有信息都在这里
对于新版本,而不是:
ipython nbconvert --to python <YourNotebook>.ipynb
你可以用jupyter代替ipython:
jupyter nbconvert --to python <YourNotebook>.ipynb
就我而言,最适合我的命令是:
jupyter nbconvert --execute --clear-output <notebook>.ipynb
为什么?此命令不会创建额外的文件(就像.py文件一样),并且每次执行notebook时都会覆盖单元格的输出。
如果你运行:
jupyter nbconvert --help
——clear-output 清除当前文件的输出并保存到位,覆盖现有的笔记本。
您还可以使用野猪包在python代码中运行您的笔记本。
from boar.running import run_notebook
outputs = run_notebook("nb.ipynb")
如果你更新了你的笔记本,你不需要再次将它转换为python文件。
更多信息请浏览:
https://github.com/alexandreCameron/boar/blob/master/USAGE.md
从终端运行
jupyter nbconvert --execute --to notebook --inplace --allow-errors --ExecutePreprocessor.timeout=-1 my_nb.ipynb
默认超时时间为30秒。-1删除限制。
如果你想保存输出的笔记本到一个新的笔记本,你可以使用标志——output my_new_nb.ipynb
我也有同样的问题,我找到了造纸厂。相对于其他解决方案的优点是,您可以在笔记本运行时看到结果。当笔记本花费很长时间时,我发现这个功能很有趣。它非常容易使用:
pip install papermill
papermill notebook.ipynb output.ipynb
它还,其他方便的选择输出文件保存到Amazon S3,谷歌云等。有关更多信息,请参阅页面。
使用ipython:
ipython --TerminalIPythonApp.file_to_run=<notebook>.ipynb
通常情况下,我更喜欢这个选项,因为它是真正的自我描述。如果你喜欢使用较少的字符,请使用:
ipython -c "%run <notebook>.ipynb"
这基本上就是Keto作为评论所建议的(不幸的是有点隐藏)。
你也可以使用jupytext https://jupytext.readthedocs.io/en/latest/index.html。
这可以让你的笔记本配对。所以对于每个ipynb文件,你都有一个。py文件,以及一些注释。.py文件可以照常执行。 你可以享受两个世界的好处,但代价是额外的一个文件。
哦,顺便说一下,如果你使用版本控制,你只能提交带有漂亮diff的.py文件,而不是丑陋的.ipynb diff。
(在.py文件的语法类似于Databricks笔记本,如果你熟悉他们…)
在批处理文件中粘贴以下内容。使用ipython运行。ipynb文件。
@echo on
call "C:\ProgramData\Anaconda3\Scripts\activate.bat"
ipython "path\test.ipynb"
pause
我对这个主题做了一些研究,并写了一篇关于在命令行中运行Jupyter Notebook的4种方法的文章,下面是我的发现的总结。
1. 使用nbconvert
nbconvert包已经安装在Jupyter Notebook中。它可以用来执行笔记本电脑。此外,它有许多特点:
可以将笔记本导出为PDF或HTML, 可以隐藏代码在输出笔记本, 即使在单元格中有错误,也可以执行笔记本。
笔记本执行示例:
jupyter nbconvert --execute --to notebook --allow-errors your-notebook.ipynb
上面的命令将输出your-notebook.nbconvert。Ipynb文件,即使有错误,也会执行所有单元格。
2. 利用造纸厂
造纸厂允许你参数化笔记本。您可以将变量定义为参数(使用单元格标记)。
示例命令:
papermill -p name Piotrek your-notebook.ipynb output-notebook.ipynb
注入参数的笔记本示例:
3.手动下载笔记本为.py脚本
有一个选项可以手动下载notebook为.py脚本:
下载后,您可以向文件添加执行权限,并将其作为命令行脚本运行。
4. 使用jupytext
jupytext包允许你同步。ipynb文件和。py文件。您不需要手动将笔记本转换为脚本。
现在有一个jupyter run子命令将执行一个笔记本。
jupyter run notebook.ipynb
关于这个命令的更多信息可以在Jupyter文档中找到。