我也有同样的问题，我找到了造纸厂。相对于其他解决方案的优点是，您可以在笔记本运行时看到结果。当笔记本花费很长时间时，我发现这个功能很有趣。它非常容易使用:

pip install papermill
papermill notebook.ipynb output.ipynb

它还,其他方便的选择输出文件保存到Amazon S3,谷歌云等。有关更多信息，请参阅页面。

就我而言，最适合我的命令是:

jupyter nbconvert --execute --clear-output <notebook>.ipynb

为什么?此命令不会创建额外的文件(就像.py文件一样)，并且每次执行notebook时都会覆盖单元格的输出。

如果你运行:

jupyter nbconvert --help

——clear-output 清除当前文件的输出并保存到位，覆盖现有的笔记本。

对于新版本，而不是:

ipython nbconvert --to python <YourNotebook>.ipynb

你可以用jupyter代替ipython:

jupyter nbconvert --to python <YourNotebook>.ipynb

你也可以使用jupytext https://jupytext.readthedocs.io/en/latest/index.html。

这可以让你的笔记本配对。所以对于每个ipynb文件，你都有一个。py文件，以及一些注释。.py文件可以照常执行。 你可以享受两个世界的好处，但代价是额外的一个文件。

哦，顺便说一下，如果你使用版本控制，你只能提交带有漂亮diff的.py文件，而不是丑陋的.ipynb diff。

(在.py文件的语法类似于Databricks笔记本，如果你熟悉他们…)

更新引用作者的评论，以获得更好的可视性:

作者注:“这个项目开始于Jupyter的执行API之前，这是现在从命令行运行笔记本的推荐方式。考虑runipy已弃用且无法维护。”——塞巴斯蒂安·帕尔马

安装允许在终端上运行代码的runipy库

pip install runipy

编译代码后:

runipy <YourNotebookName>.ipynb

你也可以试试cronjob。所有信息都在这里

从终端运行

jupyter nbconvert --execute --to notebook --inplace --allow-errors --ExecutePreprocessor.timeout=-1 my_nb.ipynb

默认超时时间为30秒。-1删除限制。

如果你想保存输出的笔记本到一个新的笔记本，你可以使用标志——output my_new_nb.ipynb