就我而言，最适合我的命令是:

jupyter nbconvert --execute --clear-output <notebook>.ipynb

为什么?此命令不会创建额外的文件(就像.py文件一样)，并且每次执行notebook时都会覆盖单元格的输出。

如果你运行:

jupyter nbconvert --help

——clear-output 清除当前文件的输出并保存到位，覆盖现有的笔记本。

更新引用作者的评论，以获得更好的可视性:

作者注:“这个项目开始于Jupyter的执行API之前，这是现在从命令行运行笔记本的推荐方式。考虑runipy已弃用且无法维护。”——塞巴斯蒂安·帕尔马

安装允许在终端上运行代码的runipy库

pip install runipy

编译代码后:

runipy <YourNotebookName>.ipynb

你也可以试试cronjob。所有信息都在这里

我对这个主题做了一些研究，并写了一篇关于在命令行中运行Jupyter Notebook的4种方法的文章，下面是我的发现的总结。

1. 使用nbconvert

nbconvert包已经安装在Jupyter Notebook中。它可以用来执行笔记本电脑。此外，它有许多特点:

可以将笔记本导出为PDF或HTML， 可以隐藏代码在输出笔记本， 即使在单元格中有错误，也可以执行笔记本。

笔记本执行示例:

jupyter nbconvert --execute --to notebook --allow-errors your-notebook.ipynb 

上面的命令将输出your-notebook.nbconvert。Ipynb文件，即使有错误，也会执行所有单元格。

2. 利用造纸厂

造纸厂允许你参数化笔记本。您可以将变量定义为参数(使用单元格标记)。

示例命令:

papermill -p name Piotrek your-notebook.ipynb output-notebook.ipynb

注入参数的笔记本示例:

3.手动下载笔记本为.py脚本

有一个选项可以手动下载notebook为.py脚本:

下载后，您可以向文件添加执行权限，并将其作为命令行脚本运行。

4. 使用jupytext

jupytext包允许你同步。ipynb文件和。py文件。您不需要手动将笔记本转换为脚本。

Nbconvert允许你使用——execute标志运行笔记本:

jupyter nbconvert --execute <notebook>

如果你想运行一个笔记本并生成一个新的笔记本，你可以添加——到笔记本:

jupyter nbconvert --execute --to notebook <notebook>

或者如果你想用新的输出替换现有的笔记本:

jupyter nbconvert --execute --to notebook --inplace <notebook>

因为这是一个非常长的命令，你可以使用别名:

alias nbx="jupyter nbconvert --execute --to notebook"
nbx [--inplace] <notebook>

现在有一个jupyter run子命令将执行一个笔记本。

jupyter run notebook.ipynb

关于这个命令的更多信息可以在Jupyter文档中找到。

我也有同样的问题，我找到了造纸厂。相对于其他解决方案的优点是，您可以在笔记本运行时看到结果。当笔记本花费很长时间时，我发现这个功能很有趣。它非常容易使用:

pip install papermill
papermill notebook.ipynb output.ipynb

它还,其他方便的选择输出文件保存到Amazon S3,谷歌云等。有关更多信息，请参阅页面。