从终端运行

jupyter nbconvert --execute --to notebook --inplace --allow-errors --ExecutePreprocessor.timeout=-1 my_nb.ipynb

默认超时时间为30秒。-1删除限制。

如果你想保存输出的笔记本到一个新的笔记本，你可以使用标志——output my_new_nb.ipynb

更新引用作者的评论，以获得更好的可视性:

作者注:“这个项目开始于Jupyter的执行API之前，这是现在从命令行运行笔记本的推荐方式。考虑runipy已弃用且无法维护。”——塞巴斯蒂安·帕尔马

安装允许在终端上运行代码的runipy库

pip install runipy

编译代码后:

runipy <YourNotebookName>.ipynb

你也可以试试cronjob。所有信息都在这里

我也有同样的问题，我找到了造纸厂。相对于其他解决方案的优点是，您可以在笔记本运行时看到结果。当笔记本花费很长时间时，我发现这个功能很有趣。它非常容易使用:

pip install papermill
papermill notebook.ipynb output.ipynb

它还,其他方便的选择输出文件保存到Amazon S3,谷歌云等。有关更多信息，请参阅页面。

就我而言，最适合我的命令是:

jupyter nbconvert --execute --clear-output <notebook>.ipynb

为什么?此命令不会创建额外的文件(就像.py文件一样)，并且每次执行notebook时都会覆盖单元格的输出。

如果你运行:

jupyter nbconvert --help

——clear-output 清除当前文件的输出并保存到位，覆盖现有的笔记本。

您还可以使用野猪包在python代码中运行您的笔记本。

from boar.running import run_notebook

outputs = run_notebook("nb.ipynb")

如果你更新了你的笔记本，你不需要再次将它转换为python文件。

更多信息请浏览:

https://github.com/alexandreCameron/boar/blob/master/USAGE.md

使用ipython:

ipython --TerminalIPythonApp.file_to_run=<notebook>.ipynb

通常情况下，我更喜欢这个选项，因为它是真正的自我描述。如果你喜欢使用较少的字符，请使用:

ipython -c "%run <notebook>.ipynb"

这基本上就是Keto作为评论所建议的(不幸的是有点隐藏)。