对于你的每一个数据帧列，你可以得到分位数:

q = df["col"].quantile(0.99)

然后用:

df[df["col"] < q]

如果需要移除上下异常值，将condition与and语句结合:

q_low = df["col"].quantile(0.01)
q_hi  = df["col"].quantile(0.99)

df_filtered = df[(df["col"] < q_hi) & (df["col"] > q_low)]

像在numpy.array中那样使用布尔索引

df = pd.DataFrame({'Data':np.random.normal(size=200)})
# example dataset of normally distributed data. 

df[np.abs(df.Data-df.Data.mean()) <= (3*df.Data.std())]
# keep only the ones that are within +3 to -3 standard deviations in the column 'Data'.

df[~(np.abs(df.Data-df.Data.mean()) > (3*df.Data.std()))]
# or if you prefer the other way around

对于一个系列，它是类似的:

S = pd.Series(np.random.normal(size=200))
S[~((S-S.mean()).abs() > 3*S.std())]

这个答案类似于@tanemaki提供的答案，但使用了lambda表达式而不是scipy stats。

df = pd.DataFrame(np.random.randn(100, 3), columns=list('ABC'))

standard_deviations = 3
df[df.apply(lambda x: np.abs(x - x.mean()) / x.std() < standard_deviations)
   .all(axis=1)]

要过滤只有一个列的数据帧(例如:B)在三个标准差之内:

df[((df['B'] - df['B'].mean()) / df['B'].std()).abs() < standard_deviations]

关于如何在滚动的基础上应用这个z-score:滚动z-score应用于pandas数据框架

对于数据框架中的每个系列，您可以使用between和分位数来删除异常值。

x = pd.Series(np.random.normal(size=200)) # with outliers
x = x[x.between(x.quantile(.25), x.quantile(.75))] # without outliers

另一种选择是转换数据，以减轻异常值的影响。你可以通过winsorize你的数据来做到这一点。

import pandas as pd
from scipy.stats import mstats
%matplotlib inline

test_data = pd.Series(range(30))
test_data.plot()

# Truncate values to the 5th and 95th percentiles
transformed_test_data = pd.Series(mstats.winsorize(test_data, limits=[0.05, 0.05])) 
transformed_test_data.plot()

#------------------------------------------------------------------------------
# accept a dataframe, remove outliers, return cleaned data in a new dataframe
# see http://www.itl.nist.gov/div898/handbook/prc/section1/prc16.htm
#------------------------------------------------------------------------------
def remove_outlier(df_in, col_name):
    q1 = df_in[col_name].quantile(0.25)
    q3 = df_in[col_name].quantile(0.75)
    iqr = q3-q1 #Interquartile range
    fence_low  = q1-1.5*iqr
    fence_high = q3+1.5*iqr
    df_out = df_in.loc[(df_in[col_name] > fence_low) & (df_in[col_name] < fence_high)]
    return df_out