我有一个很少列的熊猫数据帧。
现在我知道某些行是基于某个列值的异常值。
例如
列“Vol”的所有值都在12xx左右,其中一个值是4000(离群值)。
现在我想排除那些Vol列像这样的行。
所以,本质上,我需要在数据帧上放一个过滤器,这样我们就可以选择所有的行,其中某一列的值距离平均值在3个标准差之内。
实现这一点的优雅方式是什么?
我有一个很少列的熊猫数据帧。
现在我知道某些行是基于某个列值的异常值。
例如
列“Vol”的所有值都在12xx左右,其中一个值是4000(离群值)。
现在我想排除那些Vol列像这样的行。
所以,本质上,我需要在数据帧上放一个过滤器,这样我们就可以选择所有的行,其中某一列的值距离平均值在3个标准差之内。
实现这一点的优雅方式是什么?
当前回答
你可以使用布尔掩码:
import pandas as pd
def remove_outliers(df, q=0.05):
upper = df.quantile(1-q)
lower = df.quantile(q)
mask = (df < upper) & (df > lower)
return mask
t = pd.DataFrame({'train': [1,1,2,3,4,5,6,7,8,9,9],
'y': [1,0,0,1,1,0,0,1,1,1,0]})
mask = remove_outliers(t['train'], 0.1)
print(t[mask])
输出:
train y
2 2 0
3 3 1
4 4 1
5 5 0
6 6 0
7 7 1
8 8 1
其他回答
scipy。Stats有方法trim1()和trimboth(),根据排名和被删除值的引入百分比,在单行中删除异常值。
#------------------------------------------------------------------------------
# accept a dataframe, remove outliers, return cleaned data in a new dataframe
# see http://www.itl.nist.gov/div898/handbook/prc/section1/prc16.htm
#------------------------------------------------------------------------------
def remove_outlier(df_in, col_name):
q1 = df_in[col_name].quantile(0.25)
q3 = df_in[col_name].quantile(0.75)
iqr = q3-q1 #Interquartile range
fence_low = q1-1.5*iqr
fence_high = q3+1.5*iqr
df_out = df_in.loc[(df_in[col_name] > fence_low) & (df_in[col_name] < fence_high)]
return df_out
你可以使用布尔掩码:
import pandas as pd
def remove_outliers(df, q=0.05):
upper = df.quantile(1-q)
lower = df.quantile(q)
mask = (df < upper) & (df > lower)
return mask
t = pd.DataFrame({'train': [1,1,2,3,4,5,6,7,8,9,9],
'y': [1,0,0,1,1,0,0,1,1,1,0]})
mask = remove_outliers(t['train'], 0.1)
print(t[mask])
输出:
train y
2 2 0
3 3 1
4 4 1
5 5 0
6 6 0
7 7 1
8 8 1
这个答案类似于@tanemaki提供的答案,但使用了lambda表达式而不是scipy stats。
df = pd.DataFrame(np.random.randn(100, 3), columns=list('ABC'))
standard_deviations = 3
df[df.apply(lambda x: np.abs(x - x.mean()) / x.std() < standard_deviations)
.all(axis=1)]
要过滤只有一个列的数据帧(例如:B)在三个标准差之内:
df[((df['B'] - df['B'].mean()) / df['B'].std()).abs() < standard_deviations]
关于如何在滚动的基础上应用这个z-score:滚动z-score应用于pandas数据框架
删除至少一列中有异常值的所有行
如果你的数据框架中有多列,并且想要删除至少一列中有异常值的所有行,下面的表达式可以一次性完成:
import pandas as pd
import numpy as np
from scipy import stats
df = pd.DataFrame(np.random.randn(100, 3))
df[(np.abs(stats.zscore(df)) < 3).any(axis=1)]
描述:
中的每个列,它首先计算每个值的z分数 列,相对于列的均值和标准差。 然后取绝对z分数,因为方向没有 物质,只有当它低于阈值时。 All(轴=1)确保对于每一行,所有列都满足 约束。 最后,这个条件的结果被用于索引数据帧。
基于单个列筛选其他列
为zscore指定一列,例如df[0],并删除.all(axis=1)。
df[(np.abs(stats.zscore(df[0])) < 3)]