我有一个很少列的熊猫数据帧。

现在我知道某些行是基于某个列值的异常值。

例如

列“Vol”的所有值都在12xx左右,其中一个值是4000(离群值)。

现在我想排除那些Vol列像这样的行。

所以,本质上,我需要在数据帧上放一个过滤器,这样我们就可以选择所有的行,其中某一列的值距离平均值在3个标准差之内。

实现这一点的优雅方式是什么?


当前回答

如果你的数据帧有异常值,有很多方法可以处理这些异常值:

大多数都在我的文章中提到过:读一读

在这里找到代码:Notebook

其他回答

如果你的数据帧有异常值,有很多方法可以处理这些异常值:

大多数都在我的文章中提到过:读一读

在这里找到代码:Notebook

如果你喜欢方法链接,你可以得到所有数值列的布尔条件,如下所示:

df.sub(df.mean()).div(df.std()).abs().lt(3)

每一列的每个值都将根据其是否距离平均值小于三个标准差而转换为True/False。

#------------------------------------------------------------------------------
# accept a dataframe, remove outliers, return cleaned data in a new dataframe
# see http://www.itl.nist.gov/div898/handbook/prc/section1/prc16.htm
#------------------------------------------------------------------------------
def remove_outlier(df_in, col_name):
    q1 = df_in[col_name].quantile(0.25)
    q3 = df_in[col_name].quantile(0.75)
    iqr = q3-q1 #Interquartile range
    fence_low  = q1-1.5*iqr
    fence_high = q3+1.5*iqr
    df_out = df_in.loc[(df_in[col_name] > fence_low) & (df_in[col_name] < fence_high)]
    return df_out

下面是一个包含数据和2组的完整示例:

进口:

from StringIO import StringIO
import pandas as pd
#pandas config
pd.set_option('display.max_rows', 20)

有2个组的数据示例:G1:Group 1。G2:第二组:

TESTDATA = StringIO("""G1;G2;Value
1;A;1.6
1;A;5.1
1;A;7.1
1;A;8.1

1;B;21.1
1;B;22.1
1;B;24.1
1;B;30.6

2;A;40.6
2;A;51.1
2;A;52.1
2;A;60.6

2;B;80.1
2;B;70.6
2;B;90.6
2;B;85.1
""")

读取文本数据到pandas数据框架:

df = pd.read_csv(TESTDATA, sep=";")

使用标准偏差定义离群值

stds = 1.0
outliers = df[['G1', 'G2', 'Value']].groupby(['G1','G2']).transform(
           lambda group: (group - group.mean()).abs().div(group.std())) > stds

定义过滤后的数据值和异常值:

dfv = df[outliers.Value == False]
dfo = df[outliers.Value == True]

打印结果:

print '\n'*5, 'All values with decimal 1 are non-outliers. In the other hand, all values with 6 in the decimal are.'
print '\nDef DATA:\n%s\n\nFiltred Values with %s stds:\n%s\n\nOutliers:\n%s' %(df, stds, dfv, dfo)

由于我正处于我的数据科学之旅的早期阶段,我使用下面的代码来处理异常值。

#Outlier Treatment

def outlier_detect(df):
    for i in df.describe().columns:
        Q1=df.describe().at['25%',i]
        Q3=df.describe().at['75%',i]
        IQR=Q3 - Q1
        LTV=Q1 - 1.5 * IQR
        UTV=Q3 + 1.5 * IQR
        x=np.array(df[i])
        p=[]
        for j in x:
            if j < LTV or j>UTV:
                p.append(df[i].median())
            else:
                p.append(j)
        df[i]=p
    return df