我有一个很少列的熊猫数据帧。
现在我知道某些行是基于某个列值的异常值。
例如
列“Vol”的所有值都在12xx左右,其中一个值是4000(离群值)。
现在我想排除那些Vol列像这样的行。
所以,本质上,我需要在数据帧上放一个过滤器,这样我们就可以选择所有的行,其中某一列的值距离平均值在3个标准差之内。
实现这一点的优雅方式是什么?
我有一个很少列的熊猫数据帧。
现在我知道某些行是基于某个列值的异常值。
例如
列“Vol”的所有值都在12xx左右,其中一个值是4000(离群值)。
现在我想排除那些Vol列像这样的行。
所以,本质上,我需要在数据帧上放一个过滤器,这样我们就可以选择所有的行,其中某一列的值距离平均值在3个标准差之内。
实现这一点的优雅方式是什么?
当前回答
像在numpy.array中那样使用布尔索引
df = pd.DataFrame({'Data':np.random.normal(size=200)})
# example dataset of normally distributed data.
df[np.abs(df.Data-df.Data.mean()) <= (3*df.Data.std())]
# keep only the ones that are within +3 to -3 standard deviations in the column 'Data'.
df[~(np.abs(df.Data-df.Data.mean()) > (3*df.Data.std()))]
# or if you prefer the other way around
对于一个系列,它是类似的:
S = pd.Series(np.random.normal(size=200))
S[~((S-S.mean()).abs() > 3*S.std())]
其他回答
删除至少一列中有异常值的所有行
如果你的数据框架中有多列,并且想要删除至少一列中有异常值的所有行,下面的表达式可以一次性完成:
import pandas as pd
import numpy as np
from scipy import stats
df = pd.DataFrame(np.random.randn(100, 3))
df[(np.abs(stats.zscore(df)) < 3).any(axis=1)]
描述:
中的每个列,它首先计算每个值的z分数 列,相对于列的均值和标准差。 然后取绝对z分数,因为方向没有 物质,只有当它低于阈值时。 All(轴=1)确保对于每一行,所有列都满足 约束。 最后,这个条件的结果被用于索引数据帧。
基于单个列筛选其他列
为zscore指定一列,例如df[0],并删除.all(axis=1)。
df[(np.abs(stats.zscore(df[0])) < 3)]
由于我正处于我的数据科学之旅的早期阶段,我使用下面的代码来处理异常值。
#Outlier Treatment
def outlier_detect(df):
for i in df.describe().columns:
Q1=df.describe().at['25%',i]
Q3=df.describe().at['75%',i]
IQR=Q3 - Q1
LTV=Q1 - 1.5 * IQR
UTV=Q3 + 1.5 * IQR
x=np.array(df[i])
p=[]
for j in x:
if j < LTV or j>UTV:
p.append(df[i].median())
else:
p.append(j)
df[i]=p
return df
如果你的数据帧有异常值,有很多方法可以处理这些异常值:
大多数都在我的文章中提到过:读一读
在这里找到代码:Notebook
我认为删除和删除异常值在统计上是错误的。 它使数据不同于原始数据。 也使得数据的形状不均匀,因此最好的方法是通过对数据进行对数变换来减少或避免异常值的影响。 这招对我很管用:
np.log(data.iloc[:, :])
由于我还没有看到处理数值和非数值属性的答案,这里有一个补充答案。
您可能只希望删除数值属性上的异常值(类别变量几乎不可能是异常值)。
函数定义
我扩展了@tanemaki的建议,当非数值属性也存在时处理数据:
from scipy import stats
def drop_numerical_outliers(df, z_thresh=3):
# Constrains will contain `True` or `False` depending on if it is a value below the threshold.
constrains = df.select_dtypes(include=[np.number]) \
.apply(lambda x: np.abs(stats.zscore(x)) < z_thresh, reduce=False) \
.all(axis=1)
# Drop (inplace) values set to be rejected
df.drop(df.index[~constrains], inplace=True)
使用
drop_numerical_outliers(df)
例子
想象一个数据集df,其中包含一些关于房屋的值:小巷、土地轮廓、销售价格……例:数据文档
首先,你想要在散点图上可视化数据(z-score Thresh=3):
# Plot data before dropping those greater than z-score 3.
# The scatterAreaVsPrice function's definition has been removed for readability's sake.
scatterAreaVsPrice(df)
# Drop the outliers on every attributes
drop_numerical_outliers(train_df)
# Plot the result. All outliers were dropped. Note that the red points are not
# the same outliers from the first plot, but the new computed outliers based on the new data-frame.
scatterAreaVsPrice(train_df)