正如你所描述的，主要的问题是区分拆分前和拆分后，合并bug修复等。围绕它的工具。用Perl、Ruby等语言硬编码一个脚本不会花那么长时间，就可以去除分离前和分离后的连接所产生的大部分噪音。用最简单的方法处理噪音:

在连接前/过程中删除某些行(例如包括警卫) 如果有必要，从diff输出中删除其他内容

您甚至可以这样做，只要有签入，连接就会运行，并且您已经准备好了一些与单文件版本不同的东西。

这是一个经典的例子，一个已知的反设计模式，称为blob。花点时间阅读我在这里指出的文章，也许你会发现一些有用的东西。此外，如果这个项目像它看起来的那样大，您应该考虑一些设计来防止发展成您无法控制的代码。

这让我想起了我以前的工作。似乎，在我加入之前，所有东西都在一个巨大的文件中(也是c++)。然后他们将其拆分(在完全随机的点上使用include)为大约三个(仍然是巨大的文件)。正如你所预料的那样，这个软件的质量非常糟糕。该项目总标线约为40k。(几乎没有注释，但有大量重复代码)

最后，我完全重写了这个项目。我从头开始重做项目中最糟糕的部分。当然，我想到了这个新部分和其他部分之间可能的(小)接口。然后我把这个部分插入到旧的项目中。我没有重构旧代码来创建必要的接口，只是替换了它。然后我从那里迈出了一小步，重写了旧代码。

我不得不说，这花了大约半年的时间，在此期间，除了修复错误之外，没有开发旧的代码库。

编辑:

它的大小保持在40k LOC左右，但与8年前的软件相比，新应用程序在初始版本中包含了更多的功能，可能bug也更少。重写的一个原因是我们需要新的特性，而在旧代码中引入这些特性几乎是不可能的。

该软件是为一个嵌入式系统，一个标签打印机。

我应该补充的另一点是，理论上这个项目是c++的。但它根本不是面向对象的，它可能是c。新版本是面向对象的。

一种不太危险的方法是对所有的线变化进行历史性的观察。有没有特定的函数比其他函数更稳定?可以说是变化的热点。

如果某一行在几年内没有被更改过，你可以将它移到另一个文件中，而不用太担心。我会看一下用最后一次修改注释的源代码，看看是否有任何函数可以提取出来。

好吧，我理解你的痛苦:)我也参与过一些这样的项目，它并不漂亮。这个问题没有简单的答案。

一种可行的方法是开始在所有函数中添加安全保护，也就是说，检查方法中的参数、前置/后置条件，然后最终添加单元测试，以便捕获源的当前功能。一旦你有了这些，你就可以更好地重构代码，因为如果你忘记了什么，你就会有断言和错误弹出来提醒你。

有时候，重构带来的痛苦可能会大于好处。那么，最好是让原始项目处于伪维护状态，从头开始，然后增量地添加野兽的功能。

我的0.05欧分:

重新设计整个混乱的系统，考虑到技术和业务需求，将其拆分为子系统(=许多并行维护轨道，每个并行维护轨道的代码库可能不同，显然需要高可修改性等等)。

在划分子系统时，分析变化最大的地方，并将其与不变的部分分开。这应该会显示出问题所在。将最易变化的部分分离到它们自己的模块中(例如dll)，这样模块API就可以保持完整，而不需要一直破坏BC。这样，如果需要，您可以为不同的维护分支部署不同版本的模块，同时保持核心不变。

重新设计很可能需要一个单独的项目，试图做一个移动的目标是行不通的。

至于源代码历史，我的意见是:为了新代码忘掉它吧。但是请将历史记录保存在某个地方，以便在需要时进行检查。我打赌你开始之后就不那么需要它了。

对于这个项目，您很可能需要得到管理层的支持。你可以用更快的开发时间、更少的bug、更容易的维护和更少的混乱来反驳。类似于“积极地使我们的关键软件资产具有未来的可靠性和维护可行性”:)

至少这是我开始解决问题的方式。