我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
当前回答
下面是一种连续使用两个grep的方法:
egrep -o 'abc|efg' $file | grep -A1 abc | grep efg | wc -l
返回0或正整数。
egrep -o(只显示匹配,技巧:同一行上的多个匹配会产生多行输出,就好像它们在不同的行上一样)
grep -A1 abc(打印abc及其后面的行) Grep efg | wc -l(在ABC之后的相同或后面的行中发现的efg行数为0-n,结果可用于'if") 如果需要模式匹配,可以将Grep更改为egrep等
其他回答
如果您对模式序列不感兴趣,可以使用grep。
grep -l "pattern1" filepattern*.* | xargs grep "pattern2"
例子
grep -l "vector" *.cpp | xargs grep "map"
Grep -l将找到与第一个模式匹配的所有文件,xargs将为第二个模式查找Grep。希望这能有所帮助。
我在几天前发布了一个grep替代方案,它直接支持这一点,通过多行匹配或使用条件——希望它对搜索这里的人有用。下面是示例命令的样子:
多行:
sift -lm 'abc.*efg' testfile
条件:
sift -l 'abc' testfile --followed-by 'efg'
你也可以指定'efg'必须在一定的行数内跟在'abc'后面:
sift -l 'abc' testfile --followed-within 5:'efg'
你可以在sift-tool.org上找到更多信息。
我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列,使用grep的-P选项:
grep -Pzo ">tig00000034[^>]+" file.fasta > desired_sequence.fasta
基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾,而不是换行字符 O来捕获匹配的内容,因为grep返回整行(在本例中,因为您做了-z是整个文件)。
regexp的核心是[^>],它翻译为“不大于符号”。
遗憾的是,你不能。来自grep文档:
grep搜索指定的输入FILEs(或标准输入,如果没有指定文件,或如果给出了一个连字符减号(-)作为文件名),以查找包含与给定PATTERN匹配的行。
如果你需要两个单词彼此接近,例如不超过3行,你可以这样做:
find . -exec grep -Hn -C 3 "abc" {} \; | grep -C 3 "efg"
同样的例子,但是只过滤*.txt文件:
find . -name *.txt -exec grep -Hn -C 3 "abc" {} \; | grep -C 3 "efg"
如果你想,你也可以用正则表达式替换grep命令。