我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
当前回答
下面是一种连续使用两个grep的方法:
egrep -o 'abc|efg' $file | grep -A1 abc | grep efg | wc -l
返回0或正整数。
egrep -o(只显示匹配,技巧:同一行上的多个匹配会产生多行输出,就好像它们在不同的行上一样)
grep -A1 abc(打印abc及其后面的行) Grep efg | wc -l(在ABC之后的相同或后面的行中发现的efg行数为0-n,结果可用于'if") 如果需要模式匹配,可以将Grep更改为egrep等
其他回答
#!/bin/bash
shopt -s nullglob
for file in *
do
r=$(awk '/abc/{f=1}/efg/{g=1;exit}END{print g&&f ?1:0}' file)
if [ "$r" -eq 1 ];then
echo "Found pattern in $file"
else
echo "not found"
fi
done
我非常依赖于pcregrep,但是对于更新的grep,您不需要安装它的许多特性。只需使用grep -P。
在OP的问题的例子中,我认为以下选项很好地发挥了作用,第二好的选项符合我对问题的理解:
grep -Pzo "abc(.|\n)*efg" /tmp/tes*
grep -Pzl "abc(.|\n)*efg" /tmp/tes*
我将文本复制为/tmp/test1,删除'g'并保存为/tmp/test2。下面的输出显示,第一个显示匹配的字符串,第二个只显示文件名(典型的-o显示匹配,典型的-l只显示文件名)。请注意,'z'对于多行是必要的,'(.|\n)'意味着匹配'换行符以外的任何内容'或'换行符' -即任何内容:
user@host:~$ grep -Pzo "abc(.|\n)*efg" /tmp/tes*
/tmp/test1:abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg
user@host:~$ grep -Pzl "abc(.|\n)*efg" /tmp/tes*
/tmp/test1
要确定你的版本是否足够新,运行man grep,看看顶部是否出现类似的内容:
-P, --perl-regexp
Interpret PATTERN as a Perl regular expression (PCRE, see
below). This is highly experimental and grep -P may warn of
unimplemented features.
它来自GNU grep 2.10。
你至少有几个选择
DOTALL方法
用(?s) DOTALL the。包含\n的字符 你也可以使用一个超前(?=\n)——不会在匹配中被捕获
example-text:
true
match me
false
match me one
false
match me two
true
match me three
third line!!
{BLANK_LINE}
命令:
grep -Pozi '(?s)true.+?\n(?=\n)' example-text
-p用于perl正则表达式
-o只匹配模式,而不是整行
-z允许换行
-i不区分大小写
输出:
true
match me
true
match me three
third line!!
注:
- +? makes modifier non-greedy so matches shortest string instead of largest (prevents from returning one match containing entire text)
你可以使用老式的O.G.手动方法,使用\n
命令:
grep -Pozi 'true(.|\n)+?\n(?=\n)'
输出:
true
match me
true
match me three
third line!!
我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列,使用grep的-P选项:
grep -Pzo ">tig00000034[^>]+" file.fasta > desired_sequence.fasta
基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾,而不是换行字符 O来捕获匹配的内容,因为grep返回整行(在本例中,因为您做了-z是整个文件)。
regexp的核心是[^>],它翻译为“不大于符号”。
如果你对你要找的两个字符串'abc'和'efg'之间的距离有一些估计,你可以使用:
grep -r . -e 'abc' -A num1 -B num2 | grep 'efg'
这样,第一个grep将返回'abc' + #num1行,后面是#num2行,第二个grep将筛选所有这些以获得'efg'。 然后您将知道它们同时出现在哪些文件中。