如何使用grep跨多行找到模式?

我想找到有“abc”和“efg”的文件，这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:

blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..

应该匹配。

当前回答

随着几个月前ugrep的发布:

ugrep 'abc(\n|.)+?efg'

这个工具是高度优化的速度。它也是GNU/BSD/PCRE-grep兼容的。

注意我们应该使用惰性重复+?，除非您想将所有efg行匹配在一起，直到文件中的最后一个efg。

其他回答

我不知道如何用grep做到这一点，但我会用awk做这样的事情:

awk '/abc/{ln1=NR} /efg/{ln2=NR} END{if(ln1 && ln2 && ln1 < ln2){print "found"}else{print "not found"}}' foo

不过，你需要注意如何做到这一点。您希望正则表达式匹配子字符串还是整个单词?适当添加\w标记。此外，虽然这严格符合您陈述的示例，但当abc在efg之后第二次出现时，它并不完全有效。如果你想处理这个问题，在/abc/ case等中添加一个If。

虽然sed选项是最简单、最简单的，但遗憾的是，LJ的一行程序并不是最可移植的。那些受困于C Shell(而不是bash)版本的人将需要摆脱他们的刘海:

sed -e '/abc/,/efg/\!d' [file]

不幸的是，这一行在bash等中不起作用。

在所有文件中递归搜索(在每个文件中的多行中)，同时存在两个字符串(即string1和string2在不同的行中，并且都存在于同一个文件中):

grep -r -l 'string1' * > tmp; while read p; do grep -l 'string2' $p; done < tmp; rm tmp

在所有文件中递归搜索(在每个文件中的多行中)，使用EITHER字符串存在(即string1和string2在不同的行中，并且在同一个文件中存在):

grep -r -l 'string1\|string2' *

我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列，使用grep的-P选项:

grep -Pzo ">tig00000034[^>]+"  file.fasta > desired_sequence.fasta

基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾，而不是换行字符 O来捕获匹配的内容，因为grep返回整行(在本例中，因为您做了-z是整个文件)。

regexp的核心是[^>]，它翻译为“不大于符号”。

awk一行程序:

awk '/abc/,/efg/' [file-with-content]

推荐文章