我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
当前回答
随着几个月前ugrep的发布:
ugrep 'abc(\n|.)+?efg'
这个工具是高度优化的速度。它也是GNU/BSD/PCRE-grep兼容的。
注意我们应该使用惰性重复+?,除非您想将所有efg行匹配在一起,直到文件中的最后一个efg。
其他回答
我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列,使用grep的-P选项:
grep -Pzo ">tig00000034[^>]+" file.fasta > desired_sequence.fasta
基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾,而不是换行字符 O来捕获匹配的内容,因为grep返回整行(在本例中,因为您做了-z是整个文件)。
regexp的核心是[^>],它翻译为“不大于符号”。
我不知道如何用grep做到这一点,但我会用awk做这样的事情:
awk '/abc/{ln1=NR} /efg/{ln2=NR} END{if(ln1 && ln2 && ln1 < ln2){print "found"}else{print "not found"}}' foo
不过,你需要注意如何做到这一点。您希望正则表达式匹配子字符串还是整个单词?适当添加\w标记。此外,虽然这严格符合您陈述的示例,但当abc在efg之后第二次出现时,它并不完全有效。如果你想处理这个问题,在/abc/ case等中添加一个If。
这个也能用吗?!
perl -lpne 'print $ARGV if /abc.*?efg/s' file_list
$ARGV包含从file_list读取当前文件时的文件名 /s修饰符跨换行搜索。
我在几天前发布了一个grep替代方案,它直接支持这一点,通过多行匹配或使用条件——希望它对搜索这里的人有用。下面是示例命令的样子:
多行:
sift -lm 'abc.*efg' testfile
条件:
sift -l 'abc' testfile --followed-by 'efg'
你也可以指定'efg'必须在一定的行数内跟在'abc'后面:
sift -l 'abc' testfile --followed-within 5:'efg'
你可以在sift-tool.org上找到更多信息。
文件模式*.sh对于防止目录被检查很重要。当然,一些测试也可以防止这种情况发生。
for f in *.sh
do
a=$( grep -n -m1 abc $f )
test -n "${a}" && z=$( grep -n efg $f | tail -n 1) || continue
(( ((${z/:*/}-${a/:*/})) > 0 )) && echo $f
done
The
grep -n -m1 abc $f
搜索最大1个匹配项并返回(-n)行数。 如果找到一个匹配(test -n…),找到efg的最后一个匹配(找到所有,并使用tail -n 1取最后一个匹配)。
z=$( grep -n efg $f | tail -n 1)
其他的继续。
由于结果类似于18:foofile.sh String alf="abc";我们需要从“:”开始切到行尾。
((${z/:*/}-${a/:*/}))
如果第二个表达式的最后一个匹配超过了第一个表达式的第一个匹配,则应返回正结果。
然后我们报告文件名echo $f。