#!/bin/bash
shopt -s nullglob
for file in *
do
 r=$(awk '/abc/{f=1}/efg/{g=1;exit}END{print g&&f ?1:0}' file)
 if [ "$r" -eq 1 ];then
   echo "Found pattern in $file"
 else
   echo "not found"
 fi
done

这应该可以工作:

cat FILE | egrep 'abc|efg'

如果有多个匹配项，可以使用grep -v过滤掉

作为Balu Mohan的答案的替代方案，可以只使用grep、head和tail来强制模式的顺序:

for f in FILEGLOB; do tail $f -n +$(grep -n "pattern1" $f | head -n1 | cut -d : -f 1) 2>/dev/null | grep "pattern2" &>/dev/null && echo $f; done

不过，这个不太漂亮。格式化得更容易读:

for f in FILEGLOB; do
    tail $f -n +$(grep -n "pattern1" $f | head -n1 | cut -d : -f 1) 2>/dev/null \
    | grep -q "pattern2" \
    && echo $f
done

这将打印所有“pattern2”出现在“pattern1”之后，或者两者都出现在同一行的文件名称:

$ echo "abc
def" > a.txt
$ echo "def
abc" > b.txt
$ echo "abcdef" > c.txt; echo "defabc" > d.txt
$ for f in *.txt; do tail $f -n +$(grep -n "abc" $f | head -n1 | cut -d : -f 1) 2>/dev/null | grep -q "def" && echo $f; done
a.txt
c.txt
d.txt

解释

Tail -n +i -打印第i行之后的所有行，包括 Grep -n -在匹配的行前加上行号 头-n1 -只打印第一行 Cut -d: -f 1 -打印第一个切割列，使用:作为分隔符 2>/dev/null -如果$()表达式返回空，则出现沉默尾部错误输出 Grep -q—关闭Grep并在找到匹配时立即返回，因为我们只对退出码感兴趣

我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列，使用grep的-P选项:

grep -Pzo ">tig00000034[^>]+"  file.fasta > desired_sequence.fasta

基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾，而不是换行字符 O来捕获匹配的内容，因为grep返回整行(在本例中，因为您做了-z是整个文件)。

regexp的核心是[^>]，它翻译为“不大于符号”。

下面是一种连续使用两个grep的方法:

egrep -o 'abc|efg' $file | grep -A1 abc | grep efg | wc -l

返回0或正整数。

egrep -o(只显示匹配，技巧:同一行上的多个匹配会产生多行输出，就好像它们在不同的行上一样)

grep -A1 abc(打印abc及其后面的行) Grep efg | wc -l(在ABC之后的相同或后面的行中发现的efg行数为0-n，结果可用于'if") 如果需要模式匹配，可以将Grep更改为egrep等

下面是一个受到这个答案启发的解决方案:

如果'abc'和'efg'可以在同一行: Grep -zl 'abc。*efg' <您的文件列表> 如果'abc'和'efg'必须在不同的行上: grep -Pzl '(?s)abc.*\n.;*efg' <您的文件列表>

参数:

-P使用perl兼容的正则表达式。 将输入视为一组行，每一行以0字节结束，而不是换行符。例如，grep将输入视为一行。注意，如果你不使用-l，它将显示匹配后的NUL字符，见注释。 -l list只匹配文件名。 (?s)激活PCRE_DOTALL，这意味着'。'查找任何字符或换行符。