我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
当前回答
#!/bin/bash
shopt -s nullglob
for file in *
do
r=$(awk '/abc/{f=1}/efg/{g=1;exit}END{print g&&f ?1:0}' file)
if [ "$r" -eq 1 ];then
echo "Found pattern in $file"
else
echo "not found"
fi
done
其他回答
遗憾的是,你不能。来自grep文档:
grep搜索指定的输入FILEs(或标准输入,如果没有指定文件,或如果给出了一个连字符减号(-)作为文件名),以查找包含与给定PATTERN匹配的行。
我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列,使用grep的-P选项:
grep -Pzo ">tig00000034[^>]+" file.fasta > desired_sequence.fasta
基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾,而不是换行字符 O来捕获匹配的内容,因为grep返回整行(在本例中,因为您做了-z是整个文件)。
regexp的核心是[^>],它翻译为“不大于符号”。
sed应该足够了,就像海报LJ上面说的,
而不是!d,你可以简单地使用p打印:
sed -n '/abc/,/efg/p' file
虽然sed选项是最简单、最简单的,但遗憾的是,LJ的一行程序并不是最可移植的。那些受困于C Shell(而不是bash)版本的人将需要摆脱他们的刘海:
sed -e '/abc/,/efg/\!d' [file]
不幸的是,这一行在bash等中不起作用。
Grep是这种操作的笨拙工具。
在大多数现代Linux系统中都可以找到pcregrep,可以用作
pcregrep -M 'abc.*(\n|.)*efg' test.txt
where -M,——multiline允许模式匹配多行
还有一个更新的pcre2grep。两者都是由PCRE项目提供的。
pcre2grep可以通过Mac Ports作为pcre2端口的一部分用于Mac OS X:
% sudo port install pcre2
并通过Homebrew为:
% brew install pcre
或者pcre2
% brew install pcre2
pcre2grep在Linux (Ubuntu 18.04+)上也可用
$ sudo apt install pcre2-utils # PCRE2
$ sudo apt install pcregrep # Older PCRE