我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:

blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..

应该匹配。


当前回答

遗憾的是,你不能。来自grep文档:

grep搜索指定的输入FILEs(或标准输入,如果没有指定文件,或如果给出了一个连字符减号(-)作为文件名),以查找包含与给定PATTERN匹配的行。

其他回答

如果可以使用Perl,就可以很容易地做到这一点。

perl -ne 'if (/abc/) { $abc = 1; next }; print "Found in $ARGV\n" if ($abc && /efg/); }' yourfilename.txt

您也可以使用单个正则表达式来实现这一点,但这涉及到将文件的整个内容放入单个字符串中,对于大型文件,这可能会占用太多内存。 为了完整起见,下面是该方法:

perl -e '@lines = <>; $content = join("", @lines); print "Found in $ARGV\n" if ($content =~ /abc.*efg/s);' yourfilename.txt

遗憾的是,你不能。来自grep文档:

grep搜索指定的输入FILEs(或标准输入,如果没有指定文件,或如果给出了一个连字符减号(-)作为文件名),以查找包含与给定PATTERN匹配的行。

我在几天前发布了一个grep替代方案,它直接支持这一点,通过多行匹配或使用条件——希望它对搜索这里的人有用。下面是示例命令的样子:

多行:

sift -lm 'abc.*efg' testfile

条件:

sift -l 'abc' testfile --followed-by 'efg'

你也可以指定'efg'必须在一定的行数内跟在'abc'后面:

sift -l 'abc' testfile --followed-within 5:'efg'

你可以在sift-tool.org上找到更多信息。

我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列,使用grep的-P选项:

grep -Pzo ">tig00000034[^>]+"  file.fasta > desired_sequence.fasta

基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾,而不是换行字符 O来捕获匹配的内容,因为grep返回整行(在本例中,因为您做了-z是整个文件)。

regexp的核心是[^>],它翻译为“不大于符号”。

使用ripgrep可以:

$ rg --multiline 'abc(\n|.)+?efg' test.txt
3:blah abc blah
4:blah abc blah
5:blah blah..
6:blah blah..
7:blah blah..
8:blah efg blah blah

或者其他咒语。

如果你愿意的话。作为换行符计算:

$ rg --multiline '(?s)abc.+?efg' test.txt
3:blah abc blah
4:blah abc blah
5:blah blah..
6:blah blah..
7:blah blah..
8:blah efg blah blah

或者等效于(?s)的是rg -multiline- multiline-dotall

为了回答最初的问题,它们必须在不同的行上:

$ rg——multiline 'abc.*[\n](\n|.)*efg' test.txt

如果你想让它“非贪婪”,这样你就不会用最后一个efg得到第一个abc(把它们分成成对):

$ rg——multiline 'abc.*[\n](\n|.)*?efg的用法

https://til.hashrocket.com/posts/9zneks2cbv-multiline-matches-with-ripgrep-rg