我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
当前回答
这应该可以工作:
cat FILE | egrep 'abc|efg'
如果有多个匹配项,可以使用grep -v过滤掉
其他回答
我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列,使用grep的-P选项:
grep -Pzo ">tig00000034[^>]+" file.fasta > desired_sequence.fasta
基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾,而不是换行字符 O来捕获匹配的内容,因为grep返回整行(在本例中,因为您做了-z是整个文件)。
regexp的核心是[^>],它翻译为“不大于符号”。
用银搜索器:
ag 'abc.*(\n|.)*efg' your_filename
与戒指持有者的答案相似,但用ag代替。银色搜索者的速度优势可能在这里大放异彩。
sed应该足够了,就像海报LJ上面说的,
而不是!d,你可以简单地使用p打印:
sed -n '/abc/,/efg/p' file
#!/bin/bash
shopt -s nullglob
for file in *
do
r=$(awk '/abc/{f=1}/efg/{g=1;exit}END{print g&&f ?1:0}' file)
if [ "$r" -eq 1 ];then
echo "Found pattern in $file"
else
echo "not found"
fi
done
如果可以使用Perl,就可以很容易地做到这一点。
perl -ne 'if (/abc/) { $abc = 1; next }; print "Found in $ARGV\n" if ($abc && /efg/); }' yourfilename.txt
您也可以使用单个正则表达式来实现这一点,但这涉及到将文件的整个内容放入单个字符串中,对于大型文件,这可能会占用太多内存。 为了完整起见,下面是该方法:
perl -e '@lines = <>; $content = join("", @lines); print "Found in $ARGV\n" if ($content =~ /abc.*efg/s);' yourfilename.txt