我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:

blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..

应该匹配。


当前回答

你至少有几个选择

DOTALL方法

用(?s) DOTALL the。包含\n的字符 你也可以使用一个超前(?=\n)——不会在匹配中被捕获

example-text:

true
match me

false
match me one

false
match me two

true
match me three
third line!!
{BLANK_LINE}

命令:

grep -Pozi '(?s)true.+?\n(?=\n)' example-text

-p用于perl正则表达式

-o只匹配模式,而不是整行

-z允许换行

-i不区分大小写

输出:

true                                                  
match me                                              
true                                                  
match me three                                        
third line!!

注:

- +? makes modifier non-greedy so matches shortest string instead of largest (prevents from returning one match containing entire text)

你可以使用老式的O.G.手动方法,使用\n

命令:

grep -Pozi 'true(.|\n)+?\n(?=\n)'

输出:

true                                                  
match me                                              
true                                                  
match me three                                        
third line!!

其他回答

如果可以使用Perl,就可以很容易地做到这一点。

perl -ne 'if (/abc/) { $abc = 1; next }; print "Found in $ARGV\n" if ($abc && /efg/); }' yourfilename.txt

您也可以使用单个正则表达式来实现这一点,但这涉及到将文件的整个内容放入单个字符串中,对于大型文件,这可能会占用太多内存。 为了完整起见,下面是该方法:

perl -e '@lines = <>; $content = join("", @lines); print "Found in $ARGV\n" if ($content =~ /abc.*efg/s);' yourfilename.txt

虽然sed选项是最简单、最简单的,但遗憾的是,LJ的一行程序并不是最可移植的。那些受困于C Shell(而不是bash)版本的人将需要摆脱他们的刘海:

sed -e '/abc/,/efg/\!d' [file]

不幸的是,这一行在bash等中不起作用。

我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列,使用grep的-P选项:

grep -Pzo ">tig00000034[^>]+"  file.fasta > desired_sequence.fasta

基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾,而不是换行字符 O来捕获匹配的内容,因为grep返回整行(在本例中,因为您做了-z是整个文件)。

regexp的核心是[^>],它翻译为“不大于符号”。

遗憾的是,你不能。来自grep文档:

grep搜索指定的输入FILEs(或标准输入,如果没有指定文件,或如果给出了一个连字符减号(-)作为文件名),以查找包含与给定PATTERN匹配的行。

在所有文件中递归搜索(在每个文件中的多行中),同时存在两个字符串(即string1和string2在不同的行中,并且都存在于同一个文件中):

grep -r -l 'string1' * > tmp; while read p; do grep -l 'string2' $p; done < tmp; rm tmp 

在所有文件中递归搜索(在每个文件中的多行中),使用EITHER字符串存在(即string1和string2在不同的行中,并且在同一个文件中存在):

grep -r -l 'string1\|string2' *