Grep是这种操作的笨拙工具。

在大多数现代Linux系统中都可以找到pcregrep，可以用作

pcregrep -M  'abc.*(\n|.)*efg' test.txt

where -M，——multiline允许模式匹配多行

还有一个更新的pcre2grep。两者都是由PCRE项目提供的。

pcre2grep可以通过Mac Ports作为pcre2端口的一部分用于Mac OS X:

% sudo port install pcre2 

并通过Homebrew为:

% brew install pcre

或者pcre2

% brew install pcre2

pcre2grep在Linux (Ubuntu 18.04+)上也可用

$ sudo apt install pcre2-utils # PCRE2
$ sudo apt install pcregrep    # Older PCRE

awk一行程序:

awk '/abc/,/efg/' [file-with-content]

我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列，使用grep的-P选项:

grep -Pzo ">tig00000034[^>]+"  file.fasta > desired_sequence.fasta

基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾，而不是换行字符 O来捕获匹配的内容，因为grep返回整行(在本例中，因为您做了-z是整个文件)。

regexp的核心是[^>]，它翻译为“不大于符号”。

下面是一种连续使用两个grep的方法:

egrep -o 'abc|efg' $file | grep -A1 abc | grep efg | wc -l

返回0或正整数。

egrep -o(只显示匹配，技巧:同一行上的多个匹配会产生多行输出，就好像它们在不同的行上一样)

grep -A1 abc(打印abc及其后面的行) Grep efg | wc -l(在ABC之后的相同或后面的行中发现的efg行数为0-n，结果可用于'if") 如果需要模式匹配，可以将Grep更改为egrep等

Grep是这种操作的笨拙工具。

在大多数现代Linux系统中都可以找到pcregrep，可以用作

pcregrep -M  'abc.*(\n|.)*efg' test.txt

where -M，——multiline允许模式匹配多行

还有一个更新的pcre2grep。两者都是由PCRE项目提供的。

pcre2grep可以通过Mac Ports作为pcre2端口的一部分用于Mac OS X:

% sudo port install pcre2 

并通过Homebrew为:

% brew install pcre

或者pcre2

% brew install pcre2

pcre2grep在Linux (Ubuntu 18.04+)上也可用

$ sudo apt install pcre2-utils # PCRE2
$ sudo apt install pcregrep    # Older PCRE

使用ripgrep可以:

$ rg --multiline 'abc(\n|.)+?efg' test.txt
3:blah abc blah
4:blah abc blah
5:blah blah..
6:blah blah..
7:blah blah..
8:blah efg blah blah

或者其他咒语。

如果你愿意的话。作为换行符计算:

$ rg --multiline '(?s)abc.+?efg' test.txt
3:blah abc blah
4:blah abc blah
5:blah blah..
6:blah blah..
7:blah blah..
8:blah efg blah blah

或者等效于(?s)的是rg -multiline- multiline-dotall

为了回答最初的问题，它们必须在不同的行上:

$ rg——multiline 'abc.*[\n](\n|.)*efg' test.txt

如果你想让它“非贪婪”，这样你就不会用最后一个efg得到第一个abc(把它们分成成对):

$ rg——multiline 'abc.*[\n](\n|.)*?efg的用法

https://til.hashrocket.com/posts/9zneks2cbv-multiline-matches-with-ripgrep-rg