我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:

blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..

应该匹配。


当前回答

文件模式*.sh对于防止目录被检查很重要。当然,一些测试也可以防止这种情况发生。

for f in *.sh
do
  a=$( grep -n -m1 abc $f )
  test -n "${a}" && z=$( grep -n efg $f | tail -n 1) || continue 
  (( ((${z/:*/}-${a/:*/})) > 0 )) && echo $f
done

The

grep -n -m1 abc $f 

搜索最大1个匹配项并返回(-n)行数。 如果找到一个匹配(test -n…),找到efg的最后一个匹配(找到所有,并使用tail -n 1取最后一个匹配)。

z=$( grep -n efg $f | tail -n 1)

其他的继续。

由于结果类似于18:foofile.sh String alf="abc";我们需要从“:”开始切到行尾。

((${z/:*/}-${a/:*/}))

如果第二个表达式的最后一个匹配超过了第一个表达式的第一个匹配,则应返回正结果。

然后我们报告文件名echo $f。

其他回答

如果您对模式序列不感兴趣,可以使用grep。

grep -l "pattern1" filepattern*.* | xargs grep "pattern2"

例子

grep -l "vector" *.cpp | xargs grep "map"

Grep -l将找到与第一个模式匹配的所有文件,xargs将为第二个模式查找Grep。希望这能有所帮助。

我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列,使用grep的-P选项:

grep -Pzo ">tig00000034[^>]+"  file.fasta > desired_sequence.fasta

基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾,而不是换行字符 O来捕获匹配的内容,因为grep返回整行(在本例中,因为您做了-z是整个文件)。

regexp的核心是[^>],它翻译为“不大于符号”。

Grep是这种操作的笨拙工具。

在大多数现代Linux系统中都可以找到pcregrep,可以用作

pcregrep -M  'abc.*(\n|.)*efg' test.txt

where -M,——multiline允许模式匹配多行

还有一个更新的pcre2grep。两者都是由PCRE项目提供的。

pcre2grep可以通过Mac Ports作为pcre2端口的一部分用于Mac OS X:

% sudo port install pcre2 

并通过Homebrew为:

% brew install pcre

或者pcre2

% brew install pcre2

pcre2grep在Linux (Ubuntu 18.04+)上也可用

$ sudo apt install pcre2-utils # PCRE2
$ sudo apt install pcregrep    # Older PCRE

作为Balu Mohan的答案的替代方案,可以只使用grep、head和tail来强制模式的顺序:

for f in FILEGLOB; do tail $f -n +$(grep -n "pattern1" $f | head -n1 | cut -d : -f 1) 2>/dev/null | grep "pattern2" &>/dev/null && echo $f; done

不过,这个不太漂亮。格式化得更容易读:

for f in FILEGLOB; do
    tail $f -n +$(grep -n "pattern1" $f | head -n1 | cut -d : -f 1) 2>/dev/null \
    | grep -q "pattern2" \
    && echo $f
done

这将打印所有“pattern2”出现在“pattern1”之后,或者两者都出现在同一行的文件名称:

$ echo "abc
def" > a.txt
$ echo "def
abc" > b.txt
$ echo "abcdef" > c.txt; echo "defabc" > d.txt
$ for f in *.txt; do tail $f -n +$(grep -n "abc" $f | head -n1 | cut -d : -f 1) 2>/dev/null | grep -q "def" && echo $f; done
a.txt
c.txt
d.txt

解释

Tail -n +i -打印第i行之后的所有行,包括 Grep -n -在匹配的行前加上行号 头-n1 -只打印第一行 Cut -d: -f 1 -打印第一个切割列,使用:作为分隔符 2>/dev/null -如果$()表达式返回空,则出现沉默尾部错误输出 Grep -q—关闭Grep并在找到匹配时立即返回,因为我们只对退出码感兴趣

你至少有几个选择

DOTALL方法

用(?s) DOTALL the。包含\n的字符 你也可以使用一个超前(?=\n)——不会在匹配中被捕获

example-text:

true
match me

false
match me one

false
match me two

true
match me three
third line!!
{BLANK_LINE}

命令:

grep -Pozi '(?s)true.+?\n(?=\n)' example-text

-p用于perl正则表达式

-o只匹配模式,而不是整行

-z允许换行

-i不区分大小写

输出:

true                                                  
match me                                              
true                                                  
match me three                                        
third line!!

注:

- +? makes modifier non-greedy so matches shortest string instead of largest (prevents from returning one match containing entire text)

你可以使用老式的O.G.手动方法,使用\n

命令:

grep -Pozi 'true(.|\n)+?\n(?=\n)'

输出:

true                                                  
match me                                              
true                                                  
match me three                                        
third line!!