我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
当前回答
文件模式*.sh对于防止目录被检查很重要。当然,一些测试也可以防止这种情况发生。
for f in *.sh
do
a=$( grep -n -m1 abc $f )
test -n "${a}" && z=$( grep -n efg $f | tail -n 1) || continue
(( ((${z/:*/}-${a/:*/})) > 0 )) && echo $f
done
The
grep -n -m1 abc $f
搜索最大1个匹配项并返回(-n)行数。 如果找到一个匹配(test -n…),找到efg的最后一个匹配(找到所有,并使用tail -n 1取最后一个匹配)。
z=$( grep -n efg $f | tail -n 1)
其他的继续。
由于结果类似于18:foofile.sh String alf="abc";我们需要从“:”开始切到行尾。
((${z/:*/}-${a/:*/}))
如果第二个表达式的最后一个匹配超过了第一个表达式的第一个匹配,则应返回正结果。
然后我们报告文件名echo $f。
其他回答
这可以通过首先使用tr用其他字符替换换行符来轻松完成:
tr '\n' '\a' | grep -o 'abc.*def' | tr '\a' '\n'
这里,我使用警报字符\a (ASCII 7)来代替换行符。 这在你的文本中几乎找不到,而且grep可以用一个.匹配它,或者专门用\a匹配它。
我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列,使用grep的-P选项:
grep -Pzo ">tig00000034[^>]+" file.fasta > desired_sequence.fasta
基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾,而不是换行字符 O来捕获匹配的内容,因为grep返回整行(在本例中,因为您做了-z是整个文件)。
regexp的核心是[^>],它翻译为“不大于符号”。
如果可以使用Perl,就可以很容易地做到这一点。
perl -ne 'if (/abc/) { $abc = 1; next }; print "Found in $ARGV\n" if ($abc && /efg/); }' yourfilename.txt
您也可以使用单个正则表达式来实现这一点,但这涉及到将文件的整个内容放入单个字符串中,对于大型文件,这可能会占用太多内存。 为了完整起见,下面是该方法:
perl -e '@lines = <>; $content = join("", @lines); print "Found in $ARGV\n" if ($content =~ /abc.*efg/s);' yourfilename.txt
遗憾的是,你不能。来自grep文档:
grep搜索指定的输入FILEs(或标准输入,如果没有指定文件,或如果给出了一个连字符减号(-)作为文件名),以查找包含与给定PATTERN匹配的行。
Grep是这种操作的笨拙工具。
在大多数现代Linux系统中都可以找到pcregrep,可以用作
pcregrep -M 'abc.*(\n|.)*efg' test.txt
where -M,——multiline允许模式匹配多行
还有一个更新的pcre2grep。两者都是由PCRE项目提供的。
pcre2grep可以通过Mac Ports作为pcre2端口的一部分用于Mac OS X:
% sudo port install pcre2
并通过Homebrew为:
% brew install pcre
或者pcre2
% brew install pcre2
pcre2grep在Linux (Ubuntu 18.04+)上也可用
$ sudo apt install pcre2-utils # PCRE2
$ sudo apt install pcregrep # Older PCRE