我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:

blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..

应该匹配。


当前回答

我不确定是否可以使用grep,但sed使它非常简单:

sed -e '/abc/,/efg/!d' [file-with-content]

其他回答

下面是一种连续使用两个grep的方法:

egrep -o 'abc|efg' $file | grep -A1 abc | grep efg | wc -l

返回0或正整数。

egrep -o(只显示匹配,技巧:同一行上的多个匹配会产生多行输出,就好像它们在不同的行上一样)

grep -A1 abc(打印abc及其后面的行) Grep efg | wc -l(在ABC之后的相同或后面的行中发现的efg行数为0-n,结果可用于'if") 如果需要模式匹配,可以将Grep更改为egrep等

如果你需要两个单词彼此接近,例如不超过3行,你可以这样做:

find . -exec grep -Hn -C 3 "abc" {} \; | grep -C 3 "efg"

同样的例子,但是只过滤*.txt文件:

find . -name *.txt -exec grep -Hn -C 3 "abc" {} \; | grep -C 3 "efg"

如果你想,你也可以用正则表达式替换grep命令。

我不知道如何用grep做到这一点,但我会用awk做这样的事情:

awk '/abc/{ln1=NR} /efg/{ln2=NR} END{if(ln1 && ln2 && ln1 < ln2){print "found"}else{print "not found"}}' foo

不过,你需要注意如何做到这一点。您希望正则表达式匹配子字符串还是整个单词?适当添加\w标记。此外,虽然这严格符合您陈述的示例,但当abc在efg之后第二次出现时,它并不完全有效。如果你想处理这个问题,在/abc/ case等中添加一个If。

我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列,使用grep的-P选项:

grep -Pzo ">tig00000034[^>]+"  file.fasta > desired_sequence.fasta

基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾,而不是换行字符 O来捕获匹配的内容,因为grep返回整行(在本例中,因为您做了-z是整个文件)。

regexp的核心是[^>],它翻译为“不大于符号”。

遗憾的是,你不能。来自grep文档:

grep搜索指定的输入FILEs(或标准输入,如果没有指定文件,或如果给出了一个连字符减号(-)作为文件名),以查找包含与给定PATTERN匹配的行。