我有一个名为foo的脚本。R包含另一个脚本other。R,在同一个目录下:
#!/usr/bin/env Rscript
message("Hello")
source("other.R")
但我想让R找到另一个。R,不管当前工作目录是什么。
换句话说,就是foo。R需要知道自己的路径。我该怎么做呢?
我有一个名为foo的脚本。R包含另一个脚本other。R,在同一个目录下:
#!/usr/bin/env Rscript
message("Hello")
source("other.R")
但我想让R找到另一个。R,不管当前工作目录是什么。
换句话说,就是foo。R需要知道自己的路径。我该怎么做呢?
当前回答
Supressingfire回答的简化版本:
source_local <- function(fname){
argv <- commandArgs(trailingOnly = FALSE)
base_dir <- dirname(substring(argv[grep("--file=", argv)], 8))
source(paste(base_dir, fname, sep="/"))
}
其他回答
通过查看调用堆栈,我们可以获得正在执行的每个脚本的文件路径,其中最有用的两个可能是当前正在执行的脚本,或者是要获取的第一个脚本(条目)。
script.dir.executing = (function() return( if(length(sys.parents())==1) getwd() else dirname( Filter(is.character,lapply(rev(sys.frames()),function(x) x$ofile))[[1]] ) ))()
script.dir.entry = (function() return( if(length(sys.parents())==1) getwd() else dirname(sys.frame(1)$ofile) ))()
如果而不是脚本,foo。R,知道它的路径位置,如果你可以改变你的代码,总是从一个公共根引用所有的源路径,那么这些可能会有很大的帮助:
https://github.com/r-lib/rprojroot或https://rprojroot.r-lib.org/ https://here.r-lib.org/
鉴于
/ app /深度/嵌套/ foo。R /应用程序/其他。R
这是可行的
#!/usr/bin/env Rscript
library(here)
source(here("other.R"))
参见https://rprojroot.r-lib.org/了解如何定义项目根。
我也有这个问题,上面的解决方案都不适合我。也许是来源之类的,但还不够清楚。
我找到了这个,对我来说很优雅的解决方案:
paste0(gsub("\\", "/", fileSnapshot()$path, fixed=TRUE),"/")
其中重要的是fileSnapshot(),它提供了关于文件的大量信息。它返回一个包含8个元素的列表。当您选择path作为列表元素时,路径将以\\作为分隔符返回,因此其余代码只是更改这一点。
我希望这能有所帮助。
frame_files <- lapply(sys.frames(), function(x) x$ofile)
frame_files <- Filter(Negate(is.null), frame_files)
PATH <- dirname(frame_files[[length(frame_files)]])
不要问我它是如何工作的,因为我已经忘记了:/
你可以使用commandArgs函数获取Rscript传递给实际R解释器的所有选项,并搜索——file=。如果你的脚本是从路径启动的,或者它是以一个完整的路径启动的,下面的script.name将以'/'开头。否则,它必须是相对于cwd,你可以连接两个路径,以获得完整的路径。
编辑:听起来你只需要上面的script.name,并剥离路径的最后一个组件。我已经删除了不需要的cwd()样本,并清理了主脚本,并张贴了我的其他. r。只需要保存这个脚本和其他脚本。R脚本放到同一个目录下,chmod +x它们,然后运行主脚本。
主要。接待员:
#!/usr/bin/env Rscript
initial.options <- commandArgs(trailingOnly = FALSE)
file.arg.name <- "--file="
script.name <- sub(file.arg.name, "", initial.options[grep(file.arg.name, initial.options)])
script.basename <- dirname(script.name)
other.name <- file.path(script.basename, "other.R")
print(paste("Sourcing",other.name,"from",script.name))
source(other.name)
其他。接待员:
print("hello")
输出:
burner@firefighter:~$ main.R
[1] "Sourcing /home/burner/bin/other.R from /home/burner/bin/main.R"
[1] "hello"
burner@firefighter:~$ bin/main.R
[1] "Sourcing bin/other.R from bin/main.R"
[1] "hello"
burner@firefighter:~$ cd bin
burner@firefighter:~/bin$ main.R
[1] "Sourcing ./other.R from ./main.R"
[1] "hello"
我相信这就是德曼在找的东西。