我有一个名为foo的脚本。R包含另一个脚本other。R,在同一个目录下:

#!/usr/bin/env Rscript
message("Hello")
source("other.R")

但我想让R找到另一个。R,不管当前工作目录是什么。

换句话说,就是foo。R需要知道自己的路径。我该怎么做呢?


当前回答

frame_files <- lapply(sys.frames(), function(x) x$ofile)
frame_files <- Filter(Negate(is.null), frame_files)
PATH <- dirname(frame_files[[length(frame_files)]])

不要问我它是如何工作的,因为我已经忘记了:/

其他回答

Supressingfire回答的简化版本:

source_local <- function(fname){
    argv <- commandArgs(trailingOnly = FALSE)
    base_dir <- dirname(substring(argv[grep("--file=", argv)], 8))
    source(paste(base_dir, fname, sep="/"))
}

我也有这个问题,上面的解决方案都不适合我。也许是来源之类的,但还不够清楚。

我找到了这个,对我来说很优雅的解决方案:

paste0(gsub("\\", "/", fileSnapshot()$path, fixed=TRUE),"/")

其中重要的是fileSnapshot(),它提供了关于文件的大量信息。它返回一个包含8个元素的列表。当您选择path作为列表元素时,路径将以\\作为分隔符返回,因此其余代码只是更改这一点。

我希望这能有所帮助。

这对我很有用。只是从命令行参数中greps它,去掉不需要的文本,执行dirname,最后从它获得完整的路径:

args <- commandArgs(trailingOnly = F)  
scriptPath <- normalizePath(dirname(sub("^--file=", "", args[grep("^--file=", args)])))

我喜欢steamer25的解决方案,因为它似乎是最健壮的。然而,当在RStudio中调试时(在windows中),路径不会被正确设置。原因是,如果在RStudio中设置了断点,那么源文件将使用另一个“调试源”命令,该命令将脚本路径设置得稍微不同。下面是我目前正在使用的最终版本,它解释了调试时RStudio中的这种替代行为:

# @return full path to this script
get_script_path <- function() {
    cmdArgs = commandArgs(trailingOnly = FALSE)
    needle = "--file="
    match = grep(needle, cmdArgs)
    if (length(match) > 0) {
        # Rscript
        return(normalizePath(sub(needle, "", cmdArgs[match])))
    } else {
        ls_vars = ls(sys.frames()[[1]])
        if ("fileName" %in% ls_vars) {
            # Source'd via RStudio
            return(normalizePath(sys.frames()[[1]]$fileName)) 
        } else {
            # Source'd via R console
            return(normalizePath(sys.frames()[[1]]$ofile))
        }
    }
}

只是在上面的答案的基础上,作为安全检查,您可以添加一个包装器,当sys.frame(1)失败时(如果interactive() == TRUE可能会失败),或者源脚本不在主脚本所期望的位置时,它会要求用户找到文件。

fun_path = tryCatch(expr = 
                      {file.path(dirname(sys.frame(1)$ofile), "foo.R")},
                    error = function(e){'foo.R'}
                    )
if(!file.exists(fun_path))
{
  msg = 'Please select "foo.R"'
  # ask user to find data
  if(Sys.info()[['sysname']] == 'Windows'){#choose.files is only available on Windows
    message('\n\n',msg,'\n\n')
    Sys.sleep(0.5)#goes too fast for the user to see the message on some computers
    fun_path  = choose.files(
      default = file.path(gsub('\\\\', '/', Sys.getenv('USERPROFILE')),#user
                          'Documents'),
      caption = msg
    )
  }else{
    message('\n\n',msg,'\n\n')
    Sys.sleep(0.5)#goes too fast for the user to see the message on some computers
    fun_path = file.choose(new=F)
  }
}
#source the function
source(file = fun_path, 
       encoding = 'UTF-8')