确定执行脚本的路径

我有一个名为foo的脚本。R包含另一个脚本other。R，在同一个目录下:

#!/usr/bin/env Rscript
message("Hello")
source("other.R")

但我想让R找到另一个。R，不管当前工作目录是什么。

换句话说，就是foo。R需要知道自己的路径。我该怎么做呢?

当前回答

我对上面的实现有问题，因为我的脚本是从符号链接目录操作的，或者至少这就是为什么我认为上面的解决方案不适合我。按照@ennuikiller的回答，我将Rscript包装在bash中。我使用pwd -P设置路径变量，它解析符号链接目录结构。然后将路径传递给Rscript。

Bash.sh

#!/bin/bash

# set path variable
path=`pwd -P`

#Run Rscript with path argument
Rscript foo.R $path

foo。R

args <- commandArgs(trailingOnly=TRUE)
setwd(args[1])
source(other.R)

其他回答

如果而不是脚本，foo。R，知道它的路径位置，如果你可以改变你的代码，总是从一个公共根引用所有的源路径，那么这些可能会有很大的帮助:

https://github.com/r-lib/rprojroot或https://rprojroot.r-lib.org/ https://here.r-lib.org/

鉴于

/ app /深度/嵌套/ foo。R /应用程序/其他。R

这是可行的

#!/usr/bin/env Rscript
library(here)
source(here("other.R"))

参见https://rprojroot.r-lib.org/了解如何定义项目根。

解决方案在2016年出现。非常感谢作者，Sahil Seth!

CRAN和github上的funr包提供了sys.script()函数，该函数获取当前脚本的完整路径。它甚至引用了一个类似的SO帖子。

因此，解是:

myscript。接待员:

#!/usr/bin/env Rscript
f  <-  funr::sys.script()
show(f)

然后执行命令:

user@somewhere:/home$ Rscript myscript.R

将在命令行输出，例如:

"/home/path/to/myscript.R"

到控制台。

参见R.utils包的findSourceTraceback()，其中

查找source()在所有调用帧中生成的所有'srcfile'对象。这使得可以找出当前由source()编写脚本的文件。

我也有这个问题，上面的解决方案都不适合我。也许是来源之类的，但还不够清楚。

我找到了这个，对我来说很优雅的解决方案:

paste0(gsub("\\", "/", fileSnapshot()$path, fixed=TRUE),"/")

其中重要的是fileSnapshot()，它提供了关于文件的大量信息。它返回一个包含8个元素的列表。当您选择path作为列表元素时，路径将以\\作为分隔符返回，因此其余代码只是更改这一点。

我希望这能有所帮助。

请注意，getopt包提供了get_Rscript_filename函数，该函数使用与本文相同的解决方案，但已经在标准R模块中为您编写了该解决方案，因此您不必将“获取脚本路径”函数复制并粘贴到您编写的每个脚本中。

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