我有一个名为foo的脚本。R包含另一个脚本other。R，在同一个目录下:
#!/usr/bin/env Rscript
message("Hello")
source("other.R")
但我想让R找到另一个。R，不管当前工作目录是什么。
换句话说，就是foo。R需要知道自己的路径。我该怎么做呢?
当前回答
请注意，getopt包提供了get_Rscript_filename函数，该函数使用与本文相同的解决方案，但已经在标准R模块中为您编写了该解决方案，因此您不必将“获取脚本路径”函数复制并粘贴到您编写的每个脚本中。
其他回答
Supressingfire回答的简化版本:
source_local <- function(fname){
argv <- commandArgs(trailingOnly = FALSE)
base_dir <- dirname(substring(argv[grep("--file=", argv)], 8))
source(paste(base_dir, fname, sep="/"))
}
只是在上面的答案的基础上，作为安全检查，您可以添加一个包装器，当sys.frame(1)失败时(如果interactive() == TRUE可能会失败)，或者源脚本不在主脚本所期望的位置时，它会要求用户找到文件。
fun_path = tryCatch(expr =
{file.path(dirname(sys.frame(1)$ofile), "foo.R")},
error = function(e){'foo.R'}
)
if(!file.exists(fun_path))
{
msg = 'Please select "foo.R"'
# ask user to find data
if(Sys.info()[['sysname']] == 'Windows'){#choose.files is only available on Windows
message('\n\n',msg,'\n\n')
Sys.sleep(0.5)#goes too fast for the user to see the message on some computers
fun_path = choose.files(
default = file.path(gsub('\\\\', '/', Sys.getenv('USERPROFILE')),#user
'Documents'),
caption = msg
)
}else{
message('\n\n',msg,'\n\n')
Sys.sleep(0.5)#goes too fast for the user to see the message on some computers
fun_path = file.choose(new=F)
}
}
#source the function
source(file = fun_path,
encoding = 'UTF-8')
Steamer25的方法是有效的，但前提是路径中没有空白。在macOS上，至少cmdArgs[match]返回类似/base/some~+~dir~+~带~+~空格/ for /base/some\ dir\带\空格/。
我通过在返回之前用一个简单的空格替换“~+~”来解决这个问题。
thisFile <- function() {
cmdArgs <- commandArgs(trailingOnly = FALSE)
needle <- "--file="
match <- grep(needle, cmdArgs)
if (length(match) > 0) {
# Rscript
path <- cmdArgs[match]
path <- gsub("\\~\\+\\~", " ", path)
return(normalizePath(sub(needle, "", path)))
} else {
# 'source'd via R console
return(normalizePath(sys.frames()[[1]]$ofile))
}
}
显然，你仍然可以像aprstar那样扩展else块。
我的一切都在一个!(—2019年9月1日更新以处理RStudio控制台)
#' current script file (in full path)
#' @description current script file (in full path)
#' @examples
#' works with Rscript, source() or in RStudio Run selection, RStudio Console
#' @export
ez.csf <- function() {
# http://stackoverflow.com/a/32016824/2292993
cmdArgs = commandArgs(trailingOnly = FALSE)
needle = "--file="
match = grep(needle, cmdArgs)
if (length(match) > 0) {
# Rscript via command line
return(normalizePath(sub(needle, "", cmdArgs[match])))
} else {
ls_vars = ls(sys.frames()[[1]])
if ("fileName" %in% ls_vars) {
# Source'd via RStudio
return(normalizePath(sys.frames()[[1]]$fileName))
} else {
if (!is.null(sys.frames()[[1]]$ofile)) {
# Source'd via R console
return(normalizePath(sys.frames()[[1]]$ofile))
} else {
# RStudio Run Selection
# http://stackoverflow.com/a/35842176/2292993
pth = rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path
if (pth!='') {
return(normalizePath(pth))
} else {
# RStudio Console
tryCatch({
pth = rstudioapi::getSourceEditorContext()$path
pth = normalizePath(pth)
}, error = function(e) {
# normalizePath('') issues warning/error
pth = ''
}
)
return(pth)
}
}
}
}
}
frame_files <- lapply(sys.frames(), function(x) x$ofile)
frame_files <- Filter(Negate(is.null), frame_files)
PATH <- dirname(frame_files[[length(frame_files)]])
不要问我它是如何工作的，因为我已经忘记了:/
