我有一个名为foo的脚本。R包含另一个脚本other。R,在同一个目录下:

#!/usr/bin/env Rscript
message("Hello")
source("other.R")

但我想让R找到另一个。R,不管当前工作目录是什么。

换句话说,就是foo。R需要知道自己的路径。我该怎么做呢?


当前回答

如果而不是脚本,foo。R,知道它的路径位置,如果你可以改变你的代码,总是从一个公共根引用所有的源路径,那么这些可能会有很大的帮助:

https://github.com/r-lib/rprojroot或https://rprojroot.r-lib.org/ https://here.r-lib.org/

鉴于

/ app /深度/嵌套/ foo。R /应用程序/其他。R

这是可行的

#!/usr/bin/env Rscript
library(here)
source(here("other.R"))

参见https://rprojroot.r-lib.org/了解如何定义项目根。

其他回答

frame_files <- lapply(sys.frames(), function(x) x$ofile)
frame_files <- Filter(Negate(is.null), frame_files)
PATH <- dirname(frame_files[[length(frame_files)]])

不要问我它是如何工作的,因为我已经忘记了:/

Supressingfire回答的简化版本:

source_local <- function(fname){
    argv <- commandArgs(trailingOnly = FALSE)
    base_dir <- dirname(substring(argv[grep("--file=", argv)], 8))
    source(paste(base_dir, fname, sep="/"))
}

你可以使用commandArgs函数获取Rscript传递给实际R解释器的所有选项,并搜索——file=。如果你的脚本是从路径启动的,或者它是以一个完整的路径启动的,下面的script.name将以'/'开头。否则,它必须是相对于cwd,你可以连接两个路径,以获得完整的路径。

编辑:听起来你只需要上面的script.name,并剥离路径的最后一个组件。我已经删除了不需要的cwd()样本,并清理了主脚本,并张贴了我的其他. r。只需要保存这个脚本和其他脚本。R脚本放到同一个目录下,chmod +x它们,然后运行主脚本。

主要。接待员:

#!/usr/bin/env Rscript
initial.options <- commandArgs(trailingOnly = FALSE)
file.arg.name <- "--file="
script.name <- sub(file.arg.name, "", initial.options[grep(file.arg.name, initial.options)])
script.basename <- dirname(script.name)
other.name <- file.path(script.basename, "other.R")
print(paste("Sourcing",other.name,"from",script.name))
source(other.name)

其他。接待员:

print("hello")

输出:

burner@firefighter:~$ main.R
[1] "Sourcing /home/burner/bin/other.R from /home/burner/bin/main.R"
[1] "hello"
burner@firefighter:~$ bin/main.R
[1] "Sourcing bin/other.R from bin/main.R"
[1] "hello"
burner@firefighter:~$ cd bin
burner@firefighter:~/bin$ main.R
[1] "Sourcing ./other.R from ./main.R"
[1] "hello"

我相信这就是德曼在找的东西。

这个问题有一个简单的解决办法。这个命令:

script.dir <- dirname(sys.frame(1)$ofile)

返回当前脚本文件的路径。它在保存脚本后工作。

我也有这个问题,上面的解决方案都不适合我。也许是来源之类的,但还不够清楚。

我找到了这个,对我来说很优雅的解决方案:

paste0(gsub("\\", "/", fileSnapshot()$path, fixed=TRUE),"/")

其中重要的是fileSnapshot(),它提供了关于文件的大量信息。它返回一个包含8个元素的列表。当您选择path作为列表元素时,路径将以\\作为分隔符返回,因此其余代码只是更改这一点。

我希望这能有所帮助。