其他答案所建议的无效缓存对我不起作用。在我的案例中，我发现的问题是PyCharm将Python包的init.py文件标记为文本，因此没有将它们包括在分析中，这意味着Python解析无法正确工作。

我的解决方案是:

打开PyCharm设置 导航到编辑器->文件类型 找到Python并将__init__.py添加到Python文件列表中 或查找文本并从文本文件列表中删除__init__.py

我必须去文件->无效缓存/重新启动，重新启动Ubuntu 18.04 LTS，然后打开Pycharm和文件->无效缓存/重新启动，然后才清理。

我也有同样的症状在我的例子中，问题的来源是我设置的 自定义属性中的Idea.max.intellisense.filesize =50。 我可以把它设为100。

帮助->编辑自定义属性

当失效缓存或刷新路径不起作用时，我发现自己删除并重新添加远程解释器来修复这个问题。

我使用vagrant，每隔一段时间，如果我添加一个新的虚拟机到我的多虚拟机设置，转发的端口改变，这似乎使PyCharm混淆，当它试图使用错误的SSH端口时。更改端口似乎并不能帮助损坏的引用。

很抱歉打断这个问题，但是我有一个重要的更新要做。

如果你使用的是Python 2.7.6以外的版本，你可能还想把你的项目解释器恢复到Python 2.7.6。在我安装PyCharm 4.04 professional时，这对我来说很有效，因为其他的建议都不能解决我的问题。

对我来说，这很有帮助: 更新您的主目录“标记目录为”->“源根”