当失效缓存或刷新路径不起作用时，我发现自己删除并重新添加远程解释器来修复这个问题。

我使用vagrant，每隔一段时间，如果我添加一个新的虚拟机到我的多虚拟机设置，转发的端口改变，这似乎使PyCharm混淆，当它试图使用错误的SSH端口时。更改端口似乎并不能帮助损坏的引用。

在我的例子中，它是目录结构。 我的项目是这样的:

+---dir_A
    +---dir_B
        +app
        |
        \-run.py

右键点击dir_b >将目录标记为>项目根目录

我也有同样的症状在我的例子中，问题的来源是我设置的 自定义属性中的Idea.max.intellisense.filesize =50。 我可以把它设为100。

帮助->编辑自定义属性

天哪，这是一个噩梦，我的不同的StackOVerflow答案的合并:

切换到本地解释器/usr/bin/pythonX.X和应用 像上面那样查看路径 找到骷髅的路径。我的是(/home/tim/Desktop/pycharm-community-2016.2.3/helpers/python-skeleton) 切换回virt解释器，并手动添加骷髅路径，如果它没有自动显示。

如果其他解决方案都不适合您，请尝试(备份)并删除~/。PyCharm40文件夹，然后重新打开PyCharm。这也会杀死你所有的偏好设置。

在Mac上，你需要删除~/Library/Caches/Pycharm40和~/Library/Preferences/ Pycharm40。

Windows: C:\Users\$USER.PyCharm40。

对我来说，这很有帮助: 更新您的主目录“标记目录为”->“源根”