在Python Pandas中,检查DataFrame是否有一个(或多个)NaN值的最佳方法是什么?

我知道函数pd。isnan,但这将返回每个元素的布尔值的DataFrame。这篇文章也没有完全回答我的问题。


当前回答

Jwilner的回答是正确的。我正在探索是否有更快的选择,因为根据我的经验,平坦数组的和(奇怪地)比计数快。这段代码似乎更快:

df.isnull().values.any()

import numpy as np
import pandas as pd
import perfplot


def setup(n):
    df = pd.DataFrame(np.random.randn(n))
    df[df > 0.9] = np.nan
    return df


def isnull_any(df):
    return df.isnull().any()


def isnull_values_sum(df):
    return df.isnull().values.sum() > 0


def isnull_sum(df):
    return df.isnull().sum() > 0


def isnull_values_any(df):
    return df.isnull().values.any()


perfplot.save(
    "out.png",
    setup=setup,
    kernels=[isnull_any, isnull_values_sum, isnull_sum, isnull_values_any],
    n_range=[2 ** k for k in range(25)],
)

df.isnull().sum().sum()有点慢,但当然,它有额外的信息——nan的数量。

其他回答

为此,我们可以使用df.isna().any()语句。这将检查我们所有的列,如果有任何缺失值或nan返回True,如果没有缺失值则返回False。

加上霍布斯的精彩回答,我对Python和熊猫很陌生,所以如果我错了,请指出来。

要找出哪些行有nan:

nan_rows = df[df.isnull().any(1)]

将执行相同的操作,而不需要通过将any()的轴指定为1来检查'True'是否在行中存在。

要找出特定列中哪些行有nan:

nan_rows = df[df['name column'].isnull()]

我建议使用值属性作为数组的计算是更快的。

arr = np.random.randn(100, 100)
arr[40, 40] = np.nan
df = pd.DataFrame(arr)

%timeit np.isnan(df.values).any()  # 7.56 µs
%timeit np.isnan(df).any()         # 627 µs
%timeit df.isna().any(axis=None)   # 572 µs

结果:

7.56 µs ± 447 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100000 loops each)
627 µs ± 40.3 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
572 µs ± 15.3 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)

注意:你需要在Jupyter笔记本上运行%timeit才能工作

import missingno as msno
msno.matrix(df)  # just to visualize. no missing value.