我强烈推荐使用Costura。Fody -到目前为止在程序集中嵌入资源的最好和最简单的方法。它可以作为NuGet包使用。

Install-Package Costura.Fody

将其添加到项目后，它将自动将复制到输出目录的所有引用嵌入到主程序集中。你可能想要通过添加一个目标到你的项目来清除嵌入的文件:

Install-CleanReferencesTarget

您还可以指定是否包含pdb、排除某些程序集或动态提取程序集。据我所知，也支持非托管程序集。

更新

目前，一些人正在尝试添加对DNX的支持。

更新2

对于最新的Fody版本，您需要MSBuild 16(因此Visual Studio 2019)。Fody 4.2.1版本将支持MSBuild 15。(参考:Fody只支持MSBuild 16及以上版本。当前版本:15)

这听起来可能很简单，但WinRar提供了将一堆文件压缩为自提取可执行文件的选项。 它有很多可配置的选项:最终图标，提取文件到给定的路径，提取后执行的文件，自定义logo/文本在提取期间显示的弹出窗口，根本没有弹出窗口，许可协议文本，等等。 在某些情况下可能有用。

您可以将dll作为嵌入式资源添加，然后让程序在启动时将它们解压缩到应用程序目录中(在检查它们是否已经存在之后)。

虽然制作安装文件非常容易，但我认为这样做并不值得。

编辑:这种技术对于. net程序集来说很容易。与非。NET dll，这将是更多的工作(你必须弄清楚在哪里解包文件和注册它们等等)。

如果它们实际上是托管程序集，您可以使用ILMerge。对于本地dll，您将有更多的工作要做。

请参见:如何将c++ windows dll合并到c#应用程序exe中?

在c#中创建本地/托管程序集是可能的，但并不那么容易。如果你使用c++的话，事情就简单多了，因为Visual c++编译器可以像创建其他程序集一样轻松地创建混合程序集。

除非你对生成混合程序集有严格的要求，否则我同意MusiGenesis的观点，这真的不值得用c#来麻烦。如果您需要这样做，也许可以考虑转移到c++ /CLI。

另一个可以很好地处理这个问题的产品是SmartAssembly，网址是SmartAssembly.com。该产品除了将所有依赖项合并到单个DLL中之外，还(可选地)混淆代码，删除额外的元数据以减少生成的文件大小，并且还可以实际优化IL以提高运行时性能。

它还向您的软件(如果需要的话)添加了某种全局异常处理/报告功能，这可能很有用。我相信它还有一个命令行API，因此您可以将其作为构建过程的一部分。