另一个可以很好地处理这个问题的产品是SmartAssembly，网址是SmartAssembly.com。该产品除了将所有依赖项合并到单个DLL中之外，还(可选地)混淆代码，删除额外的元数据以减少生成的文件大小，并且还可以实际优化IL以提高运行时性能。

它还向您的软件(如果需要的话)添加了某种全局异常处理/报告功能，这可能很有用。我相信它还有一个命令行API，因此您可以将其作为构建过程的一部分。

我强烈推荐使用Costura。Fody -到目前为止在程序集中嵌入资源的最好和最简单的方法。它可以作为NuGet包使用。

Install-Package Costura.Fody

将其添加到项目后，它将自动将复制到输出目录的所有引用嵌入到主程序集中。你可能想要通过添加一个目标到你的项目来清除嵌入的文件:

Install-CleanReferencesTarget

您还可以指定是否包含pdb、排除某些程序集或动态提取程序集。据我所知，也支持非托管程序集。

更新

目前，一些人正在尝试添加对DNX的支持。

更新2

对于最新的Fody版本，您需要MSBuild 16(因此Visual Studio 2019)。Fody 4.2.1版本将支持MSBuild 15。(参考:Fody只支持MSBuild 16及以上版本。当前版本:15)

在上面扩展@Bobby的回答。您可以编辑.csproj，以便在构建时使用IL-Repack自动将所有文件打包到单个程序集中。

使用Install- package ILRepack.MSBuild.Task安装nuget ILRepack.MSBuild.Task包 编辑.csproj的AfterBuild部分

下面是一个简单的示例，它将ExampleAssemblyToMerge.dll合并到项目输出中。

<!-- ILRepack -->
<Target Name="AfterBuild" Condition="'$(Configuration)' == 'Release'">

   <ItemGroup>
    <InputAssemblies Include="$(OutputPath)\$(AssemblyName).exe" />
    <InputAssemblies Include="$(OutputPath)\ExampleAssemblyToMerge.dll" />
   </ItemGroup>

   <ILRepack 
    Parallel="true"
    Internalize="true"
    InputAssemblies="@(InputAssemblies)"
    TargetKind="Exe"
    OutputFile="$(OutputPath)\$(AssemblyName).exe"
   />
</Target>

在Visual Studio中右键单击项目，选择项目属性->资源->添加资源->添加现有文件… 并将下面的代码包含到你的App.xaml.cs或等效程序中。

public App()
{
    AppDomain.CurrentDomain.AssemblyResolve +=new ResolveEventHandler(CurrentDomain_AssemblyResolve);
}

System.Reflection.Assembly CurrentDomain_AssemblyResolve(object sender, ResolveEventArgs args)
{
    string dllName = args.Name.Contains(',') ? args.Name.Substring(0, args.Name.IndexOf(',')) : args.Name.Replace(".dll","");

    dllName = dllName.Replace(".", "_");

    if (dllName.EndsWith("_resources")) return null;

    System.Resources.ResourceManager rm = new System.Resources.ResourceManager(GetType().Namespace + ".Properties.Resources", System.Reflection.Assembly.GetExecutingAssembly());

    byte[] bytes = (byte[])rm.GetObject(dllName);

    return System.Reflection.Assembly.Load(bytes);
}

以下是我的博客原文: http://codeblog.larsholm.net/2011/06/embed-dlls-easily-in-a-net-assembly/

ILMerge方法和Lars Holm Jensen处理AssemblyResolve事件都不适用于插件主机。例如，可执行文件H动态加载程序集P，并通过在单独的程序集中定义的接口IP访问它。要将IP嵌入到H one中，需要对Lars的代码进行一些修改:

Dictionary<string, Assembly> loaded = new Dictionary<string,Assembly>();
AppDomain.CurrentDomain.AssemblyResolve += (sender, args) =>
{   Assembly resAssembly;
    string dllName = args.Name.Contains(",") ? args.Name.Substring(0, args.Name.IndexOf(',')) : args.Name.Replace(".dll","");
    dllName = dllName.Replace(".", "_");
    if ( !loaded.ContainsKey( dllName ) )
    {   if (dllName.EndsWith("_resources")) return null;
        System.Resources.ResourceManager rm = new System.Resources.ResourceManager(GetType().Namespace + ".Properties.Resources", System.Reflection.Assembly.GetExecutingAssembly());
        byte[] bytes = (byte[])rm.GetObject(dllName);
        resAssembly = System.Reflection.Assembly.Load(bytes);
        loaded.Add(dllName, resAssembly);
    }
    else
    {   resAssembly = loaded[dllName];  }
    return resAssembly;
};  

处理重复尝试解析相同程序集并返回现有程序集而不是创建新实例的技巧。

编辑: 为了避免破坏. net的序列化，请确保所有没有嵌入到您的程序集中的程序集都返回null，从而默认使用标准行为。你可以通过以下方式获得这些库的列表:

static HashSet<string> IncludedAssemblies = new HashSet<string>();
string[] resources = System.Reflection.Assembly.GetExecutingAssembly().GetManifestResourceNames();
for(int i = 0; i < resources.Length; i++)
{   IncludedAssemblies.Add(resources[i]);  }

如果传递的程序集不属于IncludedAssemblies，则返回null。

如果程序集只有托管代码，ILMerge可以将程序集组合为一个程序集。您可以使用命令行应用程序，或添加对exe的引用，并以编程方式合并。对于GUI版本，有Eazfuscator和。net z，这两个都是免费的。付费应用包括BoxedApp和SmartAssembly。

如果你必须将程序集与非托管代码合并，我建议使用SmartAssembly。我在使用SmartAssembly时从未遇到过问题，但在使用其他所有产品时都遇到过问题。在这里，它可以将所需的依赖项作为资源嵌入到主exe中。

你可以手动完成所有这些，不需要担心程序集是否被管理，或者通过将dll嵌入到资源中，然后依赖AppDomain的程序集ResolveHandler来混合模式。这是一种一站式解决方案，它采用了最坏的情况，即带有非托管代码的程序集。

static void Main()
{
    AppDomain.CurrentDomain.AssemblyResolve += (sender, args) =>
    {
        string assemblyName = new AssemblyName(args.Name).Name;
        if (assemblyName.EndsWith(".resources"))
            return null;

        string dllName = assemblyName + ".dll";
        string dllFullPath = Path.Combine(GetMyApplicationSpecificPath(), dllName);

        using (Stream s = Assembly.GetEntryAssembly().GetManifestResourceStream(typeof(Program).Namespace + ".Resources." + dllName))
        {
            byte[] data = new byte[stream.Length];
            s.Read(data, 0, data.Length);

            //or just byte[] data = new BinaryReader(s).ReadBytes((int)s.Length);

            File.WriteAllBytes(dllFullPath, data);
        }

        return Assembly.LoadFrom(dllFullPath);
    };
}

The key here is to write the bytes to a file and load from its location. To avoid chicken and egg problem, you have to ensure you declare the handler before accessing assembly and that you do not access the assembly members (or instantiate anything that has to deal with the assembly) inside the loading (assembly resolving) part. Also take care to ensure GetMyApplicationSpecificPath() is not any temp directory since temp files could be attempted to get erased by other programs or by yourself (not that it will get deleted while your program is accessing the dll, but at least its a nuisance. AppData is good location). Also note that you have to write the bytes each time, you cant load from location just 'cos the dll already resides there.

对于托管dll，您不需要写入字节，而是直接从dll的位置加载，或者只是读取字节并从内存加载程序集。像这样左右:

    using (Stream s = Assembly.GetEntryAssembly().GetManifestResourceStream(typeof(Program).Namespace + ".Resources." + dllName))
    {
        byte[] data = new byte[stream.Length];
        s.Read(data, 0, data.Length);
        return Assembly.Load(data);
    }

    //or just

    return Assembly.LoadFrom(dllFullPath); //if location is known.

如果程序集是完全非托管的，您可以查看此链接或此链接以了解如何加载此类dll。