自git1.8.3（2013年4月22日）起：

一旦你用“gitsubmoduleInit”表达了对某个子模块的兴趣，就没有瓷的方式来表示“我不再对这个子模块感兴趣了”。“git submodule deinit”是这样做的方法。

删除过程还使用gitrm（自2013年10月git1.8.5起）。

总结

然后，三步移除过程将是：

0. mv a/submodule a/submodule_tmp

1. git submodule deinit -f -- a/submodule    
2. rm -rf .git/modules/a/submodule
3. git rm -f a/submodule
# Note: a/submodule (no trailing slash)

# or, if you want to leave it in your working tree and have done step 0
3.   git rm --cached a/submodule
3bis mv a/submodule_tmp a/submodule

解释

rm-rf：丹尼尔·施罗德的回答中提到了这一点，Eonil在评论中总结道：

这将使.git/modules/<子模块路径>/保持不变。所以，若您使用此方法删除了一个子模块并再次添加它们，那个么就不可能了，因为存储库已经损坏。

git rm：请参阅提交95c16418：

当前在子模块上使用“gitrm”会将子模块的工作树从超级项目的工作树中删除，并将gitlink从索引中删除。但是.gitmodules中的子模块部分保持不变，这是现在删除的子模块的剩余部分，可能会激怒用户（与.git/config中的设置相反，这必须保持提醒用户对该子模块感兴趣，以便稍后在签出旧的提交时重新填充）。

让“gitrm”不仅从工作树中删除子模块，还可以从.gitmodules文件中删除“submodule.<submodulename>”部分，并将两者都暂存，从而帮助用户。

git子模块deinit：它源于这个补丁：

使用“gitsubmodule init”，用户可以告诉git他们关心一个或多个子模块，并希望在下次调用“gitsubmodule update”时填充它。但目前，他们无法简单地告诉git他们不再关心子模块，并希望摆脱本地工作树（除非用户非常了解子模块的内部结构，并将“submodule.$name.url”设置与工作树一起从.git/config中删除）。

通过提供“deinit”命令帮助这些用户。这将删除整个子模块<对于给定的子模块（或所有已初始化的子模块，如果给定“.”）。如果当前工作树包含修改，则失败，除非强制。如果在命令行上给定的子模块的url设置在.git/config中找不到，但仍然不会失败，请进行投诉。

如果（de）初始化步骤（.git/config和.git/modules/xxx）

从git1.8.5开始，gitrm还负责：

在.gitmodules文件中记录子模块url的“add”步骤：需要为您删除它。子模块特殊条目（如这个问题所示）：gitrm将其从索引中删除：git rm—缓存的path_to_submodule（无尾斜杠）这将以特殊模式“160000”删除索引中存储的目录，并将其标记为子模块根目录。

如果您忘记了最后一步，并尝试将子模块添加为常规目录，则会收到如下错误消息：

git add mysubmodule/file.txt 
Path 'mysubmodule/file.txt' is in submodule 'mysubmodule'

注意：自从Git 2.17（2018年第二季度）以来，Git子模块deinit不再是shell脚本。这是对C函数的调用。

见Prathamesh Chavan（pratham pc）的承诺2e61273、承诺1342476（2018年1月14日）。（于2018年2月13日由Junio C Hamano--gitster--在commit ead8dbe中合并）

git ${wt_prefix:+-C "$wt_prefix"} submodule--helper deinit \
  ${GIT_QUIET:+--quiet} \
  ${prefix:+--prefix "$prefix"} \
  ${force:+--force} \
  ${deinit_all:+--all} "$@"

2012年12月我正在做的事情（结合了这些答案中的大部分）：

oldPath="vendor/example"
git config -f .git/config --remove-section "submodule.${oldPath}"
git config -f .gitmodules --remove-section "submodule.${oldPath}"
git rm --cached "${oldPath}"
rm -rf "${oldPath}"              ## remove src (optional)
rm -rf ".git/modules/${oldPath}" ## cleanup gitdir (optional housekeeping)
git add .gitmodules
git commit -m "Removed ${oldPath}"

这个问题的大多数答案都过时、不完整或不必要的复杂。

使用git 1.7.8或更高版本克隆的子模块将在您的本地存储库中最多留下四条自己的痕迹。删除这四个轨迹的过程由以下三个命令给出：

# Remove the submodule entry from .git/config
git submodule deinit -f path/to/submodule

# Remove the submodule directory from the superproject's .git/modules directory
rm -rf .git/modules/path/to/submodule

# Remove the entry in .gitmodules and remove the submodule directory located at path/to/submodule
git rm -f path/to/submodule

以下是我所做的：

1.）从.gitmodules文件中删除相关部分。您可以使用以下命令：

git config -f .gitmodules --remove-section "submodule.submodule_name"

2.）准备.gitmodules更改

git add .gitmodules

3.）从.git/config中删除相关部分。您可以使用以下命令：

git submodule deinit -f "submodule_name"

4.）删除gitlink（无尾斜杠）：

git rm --cached path_to_submodule

5.）清理.git/模块：

rm -rf .git/modules/path_to_submodule

6.）承诺：

git commit -m "Removed submodule <name>"

7.）删除现在未跟踪的子模块文件

rm -rf path_to_submodule

对于数字2.17及以上，它只是：

git submodule deinit -f {module_name}
git add {module_name}
git commit

在现代git中（我在2022年编写了这篇文章，并更新了git安装），这变得非常简单：

运行git-rm＜path to submodule＞并提交。

这将删除<path to submodule>处的文件树，以及.gitmodules文件中的子模块条目。即，删除存储库中子模块的所有痕迹。

然而，正如文档所指出的，子模块的.git目录（在主项目.git目录的模块/目录中）被保留了下来，“这样就可以在不需要从另一个存储库获取的情况下签出过去的提交”。如果您仍然想删除此信息，请手动删除.git/modules/中的子模块目录，并删除.git/config文件中的子模板条目

rm-rf.git/modules/<子模块路径>，以及git-config—删除节子模块<子模块路径>。

较旧的社区wiki说明：

通过Git子模块教程页面：

要删除子模块，您需要：

从.gitmodules文件中删除相关部分。暂存.gitmodules更改：git-add.gitmoduls从.git/config中删除相关部分。从工作树中删除子模块文件，并索引：git rm--cached path_to_submodule（无斜杠）。删除子模块的.git目录：rm-rf.git/modules/path_to_submodule提交更改：gitcommit-m“已删除子模块<name>”删除现在未跟踪的子模块文件：rm-rf path_to_submodule

另请参见：以下替代步骤。