使用Magit的简单解决方案

如果您在Emacs下使用Magit，则可以执行以下操作：

转到项目根目录，然后

M-x，magit列表子模块

then

M-x，删除magit子模块

系统将询问您要删除哪个子模块。

就是这样！

（我的Magit版本是v3.3.0）

以下是我认为必要或有用的4个步骤（首先是重要步骤）：

git rm -f the_submodule
rm -rf .git/modules/the_submodule
git config -f .git/config --remove-section submodule.the_submodule
git commit -m "..."

理论上，第1步中的git rm应该处理它。希望OP问题的第二部分有一天能够得到肯定的回答（这可以在一个命令中完成）。

但从2017年7月起，第2步必须删除.git/modules/中的数据。否则，您不能在将来重新添加子模块。

正如tinlyx的回答所指出的那样，您可能可以省去上面的两个git1.8.5+步骤，因为所有的git子模块命令似乎都有效。

步骤3删除了.git/config文件中_submodule的部分。为了完整起见，应该这样做。（该条目可能会对较旧的git版本造成问题，但我没有要测试的条目）。

为此，大多数答案建议使用git子模块deinit。我发现使用git-config-f.git/config--remove部分更加明确，也不那么令人困惑。根据git子模块文档，git deinit：

注销给定的子模块。。。如果确实要删除存储库中的子模块，并使用gitrm[1]提交相反

最后但并非最不重要的是，如果您没有gitcommit，那么在执行git子模块摘要时（从git2.7开始），您可能会遇到错误：

fatal: Not a git repository: 'the_submodule/.git'
* the_submodule 73f0d1d...0000000:

这与执行步骤2或3无关。

自git1.8.3（2013年4月22日）起：

一旦你用“gitsubmoduleInit”表达了对某个子模块的兴趣，就没有瓷的方式来表示“我不再对这个子模块感兴趣了”。“git submodule deinit”是这样做的方法。

删除过程还使用gitrm（自2013年10月git1.8.5起）。

总结

然后，三步移除过程将是：

0. mv a/submodule a/submodule_tmp

1. git submodule deinit -f -- a/submodule    
2. rm -rf .git/modules/a/submodule
3. git rm -f a/submodule
# Note: a/submodule (no trailing slash)

# or, if you want to leave it in your working tree and have done step 0
3.   git rm --cached a/submodule
3bis mv a/submodule_tmp a/submodule

解释

rm-rf：丹尼尔·施罗德的回答中提到了这一点，Eonil在评论中总结道：

这将使.git/modules/<子模块路径>/保持不变。所以，若您使用此方法删除了一个子模块并再次添加它们，那个么就不可能了，因为存储库已经损坏。

git rm：请参阅提交95c16418：

当前在子模块上使用“gitrm”会将子模块的工作树从超级项目的工作树中删除，并将gitlink从索引中删除。但是.gitmodules中的子模块部分保持不变，这是现在删除的子模块的剩余部分，可能会激怒用户（与.git/config中的设置相反，这必须保持提醒用户对该子模块感兴趣，以便稍后在签出旧的提交时重新填充）。

让“gitrm”不仅从工作树中删除子模块，还可以从.gitmodules文件中删除“submodule.<submodulename>”部分，并将两者都暂存，从而帮助用户。

git子模块deinit：它源于这个补丁：

使用“gitsubmodule init”，用户可以告诉git他们关心一个或多个子模块，并希望在下次调用“gitsubmodule update”时填充它。但目前，他们无法简单地告诉git他们不再关心子模块，并希望摆脱本地工作树（除非用户非常了解子模块的内部结构，并将“submodule.$name.url”设置与工作树一起从.git/config中删除）。

通过提供“deinit”命令帮助这些用户。这将删除整个子模块<对于给定的子模块（或所有已初始化的子模块，如果给定“.”）。如果当前工作树包含修改，则失败，除非强制。如果在命令行上给定的子模块的url设置在.git/config中找不到，但仍然不会失败，请进行投诉。

如果（de）初始化步骤（.git/config和.git/modules/xxx）

从git1.8.5开始，gitrm还负责：

在.gitmodules文件中记录子模块url的“add”步骤：需要为您删除它。子模块特殊条目（如这个问题所示）：gitrm将其从索引中删除：git rm—缓存的path_to_submodule（无尾斜杠）这将以特殊模式“160000”删除索引中存储的目录，并将其标记为子模块根目录。

如果您忘记了最后一步，并尝试将子模块添加为常规目录，则会收到如下错误消息：

git add mysubmodule/file.txt 
Path 'mysubmodule/file.txt' is in submodule 'mysubmodule'

注意：自从Git 2.17（2018年第二季度）以来，Git子模块deinit不再是shell脚本。这是对C函数的调用。

见Prathamesh Chavan（pratham pc）的承诺2e61273、承诺1342476（2018年1月14日）。（于2018年2月13日由Junio C Hamano--gitster--在commit ead8dbe中合并）

git ${wt_prefix:+-C "$wt_prefix"} submodule--helper deinit \
  ${GIT_QUIET:+--quiet} \
  ${prefix:+--prefix "$prefix"} \
  ${force:+--force} \
  ${deinit_all:+--all} "$@"

如果由于您添加、提交和推送了一个已经是Git存储库（包含.Git）的文件夹而意外添加了子模块，那么您将没有.gitmodules文件可供编辑，或者.Git/config中的任何内容。在这种情况下，您只需要：

git rm --cached subfolder
git add subfolder
git commit -m "Enter message here"
git push

FWIW，在执行git添加之前，我还删除了.git文件夹。

我发现deinit对我很好：

git submodule deinit <submodule-name>    
git rm <submodule-name>

从git文档：

解交织注销给定子模块，即删除整个子模块$名称git/config中的部分及其工作树。

使用git v2.7.4，简单的3个步骤就可以了。

git submodule deinit -f -- a/submodule    
git rm -f a/submodule
git commit