仅替换因素:

i <- sapply(bob, is.factor)
bob[i] <- lapply(bob[i], as.character)

在0.5.0版的dplyr包中引入了新的函数mutate_if:

library(dplyr)
bob %>% mutate_if(is.factor, as.character) -> bob

.．.在1.0.0版本中被across取代:

library(dplyr)
bob %>% mutate(across(where(is.factor), as.character)) -> bob

RStudio中的包purrr提供了另一种选择:

library(purrr)
bob %>% modify_if(is.factor, as.character) -> bob

只是跟着马特和德克。如果你想在不改变全局选项的情况下重新创建现有的数据帧，你可以用apply语句重新创建它:

bob <- data.frame(lapply(bob, as.character), stringsAsFactors=FALSE)

这将把所有变量转换为“character”类，如果你只想转换因子，请参阅下面Marek的解决方案。

正如@hadley指出的那样，以下内容更简洁。

bob[] <- lapply(bob, as.character)

在这两种情况下，lapply输出一个列表;然而，由于R的神奇属性，在第二种情况下使用[]保留了bob对象的data.frame类，从而消除了使用as.data.frame转换回data.frame的需要，并使用参数stringsAsFactors = FALSE。

如果你想要一个新的数据帧bobc，其中bobf中的每个因子向量都转换为字符向量，试试这个:

bobc <- rapply(bobf, as.character, classes="factor", how="replace")

如果希望将其转换回来，可以创建一个逻辑向量，其中的列是因子，并使用该逻辑向量选择性地应用因子

f <- sapply(bobf, class) == "factor"
bobc[,f] <- lapply(bobc[,f], factor)

与dplyr-package加载使用

bob=bob%>%mutate_at("phenotype", as.character)

如果您只想具体地改变表型列。

如果你使用数据。表包对data.frame的操作，那么问题就不存在了。

library(data.table)
dt = data.table(col1 = c("a","b","c"), col2 = 1:3)
sapply(dt, class)
#       col1        col2 
#"character"   "integer" 

如果你在你的数据集中已经有一个因子列，你想把它们转换成字符，你可以这样做。

library(data.table)
dt = data.table(col1 = factor(c("a","b","c")), col2 = 1:3)
sapply(dt, class)
#     col1      col2 
# "factor" "integer" 
upd.cols = sapply(dt, is.factor)
dt[, names(dt)[upd.cols] := lapply(.SD, as.character), .SDcols = upd.cols]
sapply(dt, class)
#       col1        col2 
#"character"   "integer" 

这个函数很有用

df <- stacomirtools::killfactor(df)