将data.frame列从因子转换为字符

我有一个数据帧。我们就叫他鲍勃吧:

> head(bob)
                 phenotype                         exclusion
GSM399350 3- 4- 8- 25- 44+ 11b- 11c- 19- NK1.1- Gr1- TER119-
GSM399351 3- 4- 8- 25- 44+ 11b- 11c- 19- NK1.1- Gr1- TER119-
GSM399352 3- 4- 8- 25- 44+ 11b- 11c- 19- NK1.1- Gr1- TER119-
GSM399353 3- 4- 8- 25+ 44+ 11b- 11c- 19- NK1.1- Gr1- TER119-
GSM399354 3- 4- 8- 25+ 44+ 11b- 11c- 19- NK1.1- Gr1- TER119-
GSM399355 3- 4- 8- 25+ 44+ 11b- 11c- 19- NK1.1- Gr1- TER119-

我想连接这个数据帧的行(这将是另一个问题)。但看:

> class(bob$phenotype)
[1] "factor"

Bob的列是因子。举个例子:

> as.character(head(bob))
[1] "c(3, 3, 3, 6, 6, 6)"       "c(3, 3, 3, 3, 3, 3)"      
[3] "c(29, 29, 29, 30, 30, 30)"

我不太明白这一点，但我猜这些是进入鲍勃(卡拉克塔克斯国王的法庭)的列的因子水平的指数?不是我需要的。

奇怪的是，我可以徒手浏览bob的列

bob$phenotype <- as.character(bob$phenotype)

这很好。并且，在一些输入之后，我可以得到一个data.frame，它的列是字符而不是因子。我的问题是:我如何自动地做到这一点?我如何将一个data.frame与因子列转换为一个data.frame与字符列，而不必手动遍历每一列?

附加问题:为什么手动方法有效?

当前回答

这对我来说很管用——我终于想出了一句话

df <- as.data.frame(lapply(df,function (y) if(class(y)=="factor" ) as.character(y) else y),stringsAsFactors=F)

2014-10-24 16:00:22

其他回答

你应该在hablar中使用convert，它提供了与tidyverse管道兼容的可读语法:

library(dplyr)
library(hablar)

df <- tibble(a = factor(c(1, 2, 3, 4)),
             b = factor(c(5, 6, 7, 8)))

df %>% convert(chr(a:b))

这就给了你:

  a     b    
  <chr> <chr>
1 1     5    
2 2     6    
3 3     7    
4 4     8

2019-06-10 21:25:45

这个函数很有用

df <- stacomirtools::killfactor(df)

2017-11-13 16:46:28

我通常将这个函数与我的所有项目分开。又快又简单。

unfactorize <- function(df){
  for(i in which(sapply(df, class) == "factor")) df[[i]] = as.character(df[[i]])
  return(df)
}

2013-01-10 22:25:09

在数据帧的开头包含stringsAsFactors = FALSE以忽略所有误解。

2016-01-16 15:21:54

全局选项

stringsAsFactors: data.frame和read.table参数的默认设置。

可能是你想在你的启动文件(例如~/. rprofile)中设置为FALSE。请参阅帮助(选项)。

2010-05-17 17:02:36

将data.frame列从因子转换为字符

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