或者你可以尝试transform:

newbob <- transform(bob, phenotype = as.character(phenotype))

只要确保把你想转换为字符的每一个因素。

或者你可以这样做，一击杀光所有害虫:

newbob_char <- as.data.frame(lapply(bob[sapply(bob, is.factor)], as.character), stringsAsFactors = FALSE)
newbob_rest <- bob[!(sapply(bob, is.factor))]
newbob <- cbind(newbob_char, newbob_rest)

像这样把数据塞进代码中并不是一个好主意，我可以单独做spapply部分(实际上，这样做要容易得多)，但你明白了…我还没有检查代码，因为我不在家，所以我希望它能工作!=)

然而，这种方法有一个缺点……之后你必须重新组织列，而使用transform你可以做任何你想做的事情，但代价是“行人风格的代码编写”…

所以…=)

另一种方法是使用apply转换它

bob2 <- apply(bob,2,as.character)

和一个更好的(前一个是'matrix'类)

bob2 <- as.data.frame(as.matrix(bob),stringsAsFactors=F)

也许是一个更新的选择?

library("tidyverse")

bob <- bob %>% group_by_if(is.factor, as.character)

这可以将所有内容转换为字符，然后将数字转换为数字:

makenumcols<-function(df){
  df<-as.data.frame(df)
  df[] <- lapply(df, as.character)
  cond <- apply(df, 2, function(x) {
    x <- x[!is.na(x)]
    all(suppressWarnings(!is.na(as.numeric(x))))
  })
  numeric_cols <- names(df)[cond]
  df[,numeric_cols] <- sapply(df[,numeric_cols], as.numeric)
  return(df)
}

改编自:自动获取excel表的列类型

更新:这里有一个不起作用的例子。我认为它会，但我认为stringsAsFactors选项只适用于字符串-它离开因子单独。

试试这个:

bob2 <- data.frame(bob, stringsAsFactors = FALSE)

一般来说，当你遇到应该是字符的因子的问题时，总会有一个stringsAsFactors设置来帮助你(包括一个全局设置)。

只是跟着马特和德克。如果你想在不改变全局选项的情况下重新创建现有的数据帧，你可以用apply语句重新创建它:

bob <- data.frame(lapply(bob, as.character), stringsAsFactors=FALSE)

这将把所有变量转换为“character”类，如果你只想转换因子，请参阅下面Marek的解决方案。

正如@hadley指出的那样，以下内容更简洁。

bob[] <- lapply(bob, as.character)

在这两种情况下，lapply输出一个列表;然而，由于R的神奇属性，在第二种情况下使用[]保留了bob对象的data.frame类，从而消除了使用as.data.frame转换回data.frame的需要，并使用参数stringsAsFactors = FALSE。