一个好的“最佳实践”(虽然并不总是可以实现)是为每个API提供简短的工作示例，并使用\ inclelineno(或\include表示没有行号)将它们拉入帮助。这些可以是单元测试，如果它们的编写是为了让用户能够理解它们(也就是说，没有连接到更大的测试工具中)。作为一个不错的副作用，对API的更改将破坏样本，因此它们必须保持最新。

你可以用文字来描述API，但是没有什么比看到实际的代码来理解如何使用它更好的了。

如果您有一个非常非常大的项目——大到足以让Doxygen运行一个多小时——您可以将其分割成多个模块，然后Doxygen使用标记文件将其链接在一起。

例如，如果您有一个大的MSVC解决方案，其中包含20个项目，您可以让目录运行自己的Doxygen，然后使用标记文件将输出粘合在一起，就像链接器将.libs粘合在一起以生成可执行文件一样。

您甚至可以更字面地理解链接的比喻，使每个Doxy配置文件对应于一个.vcproj文件，这样每个项目(例如.lib或.dll)都得到自己的Doxy输出。

不要用@author或@date (@date在另一篇文章中提到过)。这些都是由修订控制系统处理的。

使用组将代码组织成模块。

请记住，您可以将几乎所有内容放到多个组中，以便它们可以用于提供语义标记，就像Stack Overflow中的标记一样。例如，可以将内容标记为特定于给定平台的内容。

您还可以使用组来匹配IDE中的文件夹层次结构，如我的RB2Doxy示例输出所示。

组在嵌套时工作得很好——我有一个OOFILE源代码的大示例。

我使用一个subversion post-commit钩子来提取已经更改的目录，将它们写入一个文件，然后每天晚上我自动在我们的web服务器上重新生成doxygen html，这样我们总是有最新的docco。

我想要记录的每个项目都有一个小项目。Doxy文件，包含每个项目的设置和一个包含到主doxygen设置-例如:

PROJECT_NAME           = "AlertServer"
PROJECT_NUMBER         = 8.1.2
INPUT                  = "C:/Dev/src/8.1.2/Common/AlertServer"
HTML_OUTPUT            = "AlertServer"
@INCLUDE = "c:\dev\CommonConfig.doxy"

对于Windows SVN服务器，使用钩子:

@echo off
for /F "eol=¬ delims=¬" %%A in ('svnlook dirs-changed %1 -r %2') do echo %%A >> c:\svn_exports\export.txt

然后每晚运行:

@echo off

rem ---------------
rem remove duplicates.
type nul> %TEMP%.\TEMP.txt

for /F "eol=¬ delims=¬" %%a in (c:\svn_exports\export.txt) do (
 findstr /L /C:"%%a" < %TEMP%.\TEMP.txt > nul
 if errorlevel=1 echo %%a>> %TEMP%.\TEMP.txt
)

copy /y %TEMP%.\TEMP.txt export_uniq.cmd >nul
if exist %TEMP%.\TEMP.txt del %TEMP%.\TEMP.txt


rem ---------------
rem fetch all the recently changed directories into the svn_exports directory

for /F "eol=¬ delims=¬" %%A in (c:\svn_exports\export_uniq.cmd) do (
  svn export "file:///d:/repos/MyRepo/%%A" "c:/svn_exports/%%A"  --force 
)


rem ---------------
rem search through all dirs for any config files, if found run doxygen

for /R c:\svn_exports %%i in (*.doxy) do c:\tools\doxygen\bin\doxygen.exe "%i"


rem ---------------
rem now remove the directories to be generated.
del /F c:\svn_exports

这将删除重复的条目，找到具有.doxy项目文件的所有项目，并在它们上运行doxygen。瞧:在web服务器上有完整的文档，总是最新的代码。

如果您担心一些团队成员会避免使用文档，或者您只是想要一个最小的文档集，那么您可以在doxygen配置中启用这些。

WARNINGS               = YES
WARN_IF_UNDOCUMENTED   = YES
WARN_IF_DOC_ERROR      = YES

作为doxygen构建过程的一部分，将警告保存到一个文件中，并尝试获得并保持警告计数尽可能低(如果合理则为0)。如果这样做，每个公共和受保护类成员将至少需要一个@brief，每个函数参数的@param和一个@return。这足以描述大多数api，而不会过多妨碍其他活跃的代码库。

当然，您应该鼓励人们在每个案例的基础上尽可能多地记录他们认为需要的文档，只要他们满足最低的项目标准。但是不要将最小值设置得太高，否则最终可能得不到有用的文档。

例如，在我们的项目中，其他程序员可能接触到的所有内容都应该被记录。启用警告，让我们看看我们有多接近这个目标。我们还尝试使用@internal来描述我们对一些私有成员所做的事情。