我试图使用scikit-learn的LabelEncoder来编码字符串标签的pandas DataFrame。由于数据帧有许多(50+)列,我想避免为每一列创建一个LabelEncoder对象;我宁愿只有一个大的LabelEncoder对象,它可以跨所有数据列工作。

将整个DataFrame扔到LabelEncoder中会产生以下错误。请记住,我在这里使用的是虚拟数据;实际上,我正在处理大约50列的字符串标记数据,所以需要一个解决方案,不引用任何列的名称。

import pandas
from sklearn import preprocessing 

df = pandas.DataFrame({
    'pets': ['cat', 'dog', 'cat', 'monkey', 'dog', 'dog'], 
    'owner': ['Champ', 'Ron', 'Brick', 'Champ', 'Veronica', 'Ron'], 
    'location': ['San_Diego', 'New_York', 'New_York', 'San_Diego', 'San_Diego', 
                 'New_York']
})

le = preprocessing.LabelEncoder()

le.fit(df)

回溯(最近一次调用): 文件“”,第1行,在 文件"/Users/bbalin/anaconda/lib/python2.7/site-packages/sklearn/预处理/label.py",第103行 y = column_or_1d(y, warn=True) 文件"/Users/bbalin/anaconda/lib/python2.7/site-packages/sklearn/utils/validation.py",第306行,在column_or_1d中 raise ValueError("错误的输入形状{0}".format(形状)) ValueError:错误的输入形状(6,3)

对于如何解决这个问题有什么想法吗?


当前回答

主要使用@Alexander回答,但必须做一些更改-

cols_need_mapped = ['col1', 'col2']

mapper = {col: {cat: n for n, cat in enumerate(df[col].astype('category').cat.categories)} 
     for col in df[cols_need_mapped]}

for c in cols_need_mapped :
    df[c] = df[c].map(mapper[c])

然后,为了将来重用,你可以将输出保存到json文档中,当你需要它时,你可以读入并使用.map()函数,就像我上面所做的那样。

其他回答

我们不需要LabelEncoder。

您可以将列转换为类别,然后获取它们的代码。我使用下面的字典推导将此过程应用于每一列,并将结果包装回具有相同索引和列名的相同形状的数据框架中。

>>> pd.DataFrame({col: df[col].astype('category').cat.codes for col in df}, index=df.index)
   location  owner  pets
0         1      1     0
1         0      2     1
2         0      0     0
3         1      1     2
4         1      3     1
5         0      2     1

要创建映射字典,你可以使用字典理解式枚举类别:

>>> {col: {n: cat for n, cat in enumerate(df[col].astype('category').cat.categories)} 
     for col in df}

{'location': {0: 'New_York', 1: 'San_Diego'},
 'owner': {0: 'Brick', 1: 'Champ', 2: 'Ron', 3: 'Veronica'},
 'pets': {0: 'cat', 1: 'dog', 2: 'monkey'}}

不,LabelEncoder不这样做。它接受类标签的1维数组并生成1维数组。它的设计目的是处理分类问题中的类标签,而不是任意数据,任何强迫它用于其他用途的尝试都需要代码将实际问题转换为它解决的问题(并将解决方案转换回原始空间)。

假设你只是想获得一个sklearn.预处理. labelencoder()对象,可以用来表示你的列,你所要做的就是:

le.fit(df.columns)

在上面的代码中,每一列都有一个唯一的数字。 更精确地说,你将得到df的1:1映射。列到le.transform(df.columns.get_values())。要获得列的编码,只需将其传递给le.transform(…)。作为一个例子,下面将得到每一列的编码:

le.transform(df.columns.get_values())

假设你想为你所有的行标签创建一个sklearn.预处理. labelencoder()对象,你可以这样做:

le.fit([y for x in df.get_values() for y in x])

在本例中,您很可能拥有非唯一的行标签(如您的问题所示)。要查看编码器创建了哪些类,可以执行le.classes_。你会注意到,这应该具有与set中相同的元素(y for x in df.get_values() for y in x)。再次使用le.transform(…)将行标签转换为编码标签。例如,如果您想检索df. xml文件中第一列的标签。列数组和第一行,你可以这样做:

le.transform([df.get_value(0, df.columns[0])])

你在评论中提出的问题有点复杂,但仍然可以 完成:

le.fit([str(z) for z in set((x[0], y) for x in df.iteritems() for y in x[1])])

上面的代码实现了以下功能:

使所有(列,行)对的唯一组合 将每个对表示为元组的字符串版本。这是克服LabelEncoder类不支持元组作为类名的一种变通方法。 将新项目贴合到LabelEncoder。

现在要使用这个新模型就有点复杂了。假设我们想要提取在前一个例子中查找的同一项的表示(df中的第一列)。列和第一行),我们可以这样做:

le.transform([str((df.columns[0], df.get_value(0, df.columns[0])))])

记住,现在每个查找都是一个元组的字符串表示 包含(列、行)。

使用Neuraxle

TLDR;你可以在这里使用flatforeach包装类简单地转换你的df,如:

使用这种方法,您的标签编码器将能够在常规的scikit-learn Pipeline中适应和转换。让我们简单地导入:

from sklearn.preprocessing import LabelEncoder
from neuraxle.steps.column_transformer import ColumnTransformer
from neuraxle.steps.loop import FlattenForEach

列的共享编码器相同:

下面是一个共享的LabelEncoder将如何应用于所有数据来编码:

    p = FlattenForEach(LabelEncoder(), then_unflatten=True)

结果:

    p, predicted_output = p.fit_transform(df.values)
    expected_output = np.array([
        [6, 7, 6, 8, 7, 7],
        [1, 3, 0, 1, 5, 3],
        [4, 2, 2, 4, 4, 2]
    ]).transpose()
    assert np.array_equal(predicted_output, expected_output)

每列不同的编码器:

这里是第一个独立的LabelEncoder将如何应用于宠物,第二个将为列的所有者和位置共享。所以准确地说,我们这里有一个不同的和共享的标签编码器的组合:

    p = ColumnTransformer([
        # A different encoder will be used for column 0 with name "pets":
        (0, FlattenForEach(LabelEncoder(), then_unflatten=True)),
        # A shared encoder will be used for column 1 and 2, "owner" and "location":
        ([1, 2], FlattenForEach(LabelEncoder(), then_unflatten=True)),
    ], n_dimension=2)

结果:

    p, predicted_output = p.fit_transform(df.values)
    expected_output = np.array([
        [0, 1, 0, 2, 1, 1],
        [1, 3, 0, 1, 5, 3],
        [4, 2, 2, 4, 4, 2]
    ]).transpose()
    assert np.array_equal(predicted_output, expected_output)

根据对@PriceHardman解决方案提出的意见,我将提出以下版本的类:

class LabelEncodingColoumns(BaseEstimator, TransformerMixin):
def __init__(self, cols=None):
    pdu._is_cols_input_valid(cols)
    self.cols = cols
    self.les = {col: LabelEncoder() for col in cols}
    self._is_fitted = False

def transform(self, df, **transform_params):
    """
    Scaling ``cols`` of ``df`` using the fitting

    Parameters
    ----------
    df : DataFrame
        DataFrame to be preprocessed
    """
    if not self._is_fitted:
        raise NotFittedError("Fitting was not preformed")
    pdu._is_cols_subset_of_df_cols(self.cols, df)

    df = df.copy()

    label_enc_dict = {}
    for col in self.cols:
        label_enc_dict[col] = self.les[col].transform(df[col])

    labelenc_cols = pd.DataFrame(label_enc_dict,
        # The index of the resulting DataFrame should be assigned and
        # equal to the one of the original DataFrame. Otherwise, upon
        # concatenation NaNs will be introduced.
        index=df.index
    )

    for col in self.cols:
        df[col] = labelenc_cols[col]
    return df

def fit(self, df, y=None, **fit_params):
    """
    Fitting the preprocessing

    Parameters
    ----------
    df : DataFrame
        Data to use for fitting.
        In many cases, should be ``X_train``.
    """
    pdu._is_cols_subset_of_df_cols(self.cols, df)
    for col in self.cols:
        self.les[col].fit(df[col])
    self._is_fitted = True
    return self

这个类适合编码器的训练集,并在转换时使用适合的版本。代码的初始版本可以在这里找到。