我正在研究如何使用我的大学集群。它安装了2个R版本。系统范围R 2.11 (Debian 6.0)和R 2.14.2在非标准位置。

我正在尝试使用MPI和雪。我要运行的代码如下所示

library(snow)
library(Rmpi)
cl <- makeMPIcluster(mpi.universe.size()-1)
stopCluster(cl)
mpi.quit()

它在r2.11上没有任何问题。(我用mpirun -H localhost启动脚本,n1,n2,n3,n4 -n 1 R——slave -f code.R)。现在,当我尝试用R 2.14.2来做这件事时,我得到了以下消息:

Error: This is R 2.11.1, package 'snow' needs >= 2.12.1
In addition: Warning message:

所以R似乎加载了为r2.11编译的snow版本包。我已经在r2.14下将snow安装到我的主文件夹中,并在代码中添加了以下代码行:

.libPaths("/soft/R/lib/R/library")
.libPaths("~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.11")
print(.libPaths())
print(sessionInfo())
print(version)

错误之前的输出确认我确实在运行R 2.14.2,我的R packages文件夹在搜索路径的第一个。但我还是得到了错误。

我的问题是,如何确定R中加载的是哪个版本的包?我可以看到安装。包所有的包,其中安装,所以也许有一些功能,列出类似的信息加载包?


当前回答

使用R方法packageDescription获取已安装包的描述,对于版本,只需使用$ version as:

packageDescription("AppliedPredictiveModeling")$Version
[1] "1.1-6"

其他回答

老问题,但答案中没有我最喜欢的命令,以快速和简短的概述所有加载的包:

(.packages())

要查看所有加载的包安装了哪个版本,只需使用上面的命令对installed.packages()进行子集化。

installed.packages()[(.packages()),3]

通过更改列号(包版本为3),您可以以易于阅读的矩阵形式获得存储在installed.packages()中的任何其他信息。下面是版本号和依赖项的示例:

installed.packages()[(.packages()),c(3,5)]

你可以使用utils::packageVersion来查看安装的包的版本:

> packageVersion("snow")
[1] ‘0.3.9’

请注意,

一个包将不会被“找到”,除非它有一个包含有效版本字段的描述文件。当没有找到包目录和有合适的目录但没有有效的DESCRIPTION文件时,会给出不同的警告。

虽然听起来像是你想知道你正在运行的R的哪个版本,但在这种情况下,@Justin的sessionInfo建议是可行的。

你可以尝试这样做:

package_version (R.version) getRversion ()

GUI解决方案:

如果您正在使用RStudio,那么您可以在Packages窗格中检查包版本。

使用R方法packageDescription获取已安装包的描述,对于版本,只需使用$ version as:

packageDescription("AppliedPredictiveModeling")$Version
[1] "1.1-6"