我正在研究如何使用我的大学集群。它安装了2个R版本。系统范围R 2.11 (Debian 6.0)和R 2.14.2在非标准位置。

我正在尝试使用MPI和雪。我要运行的代码如下所示

library(snow)
library(Rmpi)
cl <- makeMPIcluster(mpi.universe.size()-1)
stopCluster(cl)
mpi.quit()

它在r2.11上没有任何问题。(我用mpirun -H localhost启动脚本,n1,n2,n3,n4 -n 1 R——slave -f code.R)。现在,当我尝试用R 2.14.2来做这件事时,我得到了以下消息:

Error: This is R 2.11.1, package 'snow' needs >= 2.12.1
In addition: Warning message:

所以R似乎加载了为r2.11编译的snow版本包。我已经在r2.14下将snow安装到我的主文件夹中,并在代码中添加了以下代码行:

.libPaths("/soft/R/lib/R/library")
.libPaths("~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.11")
print(.libPaths())
print(sessionInfo())
print(version)

错误之前的输出确认我确实在运行R 2.14.2,我的R packages文件夹在搜索路径的第一个。但我还是得到了错误。

我的问题是,如何确定R中加载的是哪个版本的包?我可以看到安装。包所有的包,其中安装,所以也许有一些功能,列出类似的信息加载包?


当前回答

使用R方法packageDescription获取已安装包的描述,对于版本,只需使用$ version as:

packageDescription("AppliedPredictiveModeling")$Version
[1] "1.1-6"

其他回答

要检查R的版本,执行:R——version

或者在R shell中打印版本$version.string的内容

EDIT

要检查已安装包的版本,请执行以下操作。

加载库之后,可以执行sessionInfo ()

但是要知道所有已安装包的列表:

packinfo <- installed.packages(fields = c("Package", "Version"))
packinfo[,c("Package", "Version")]

或来提取特定的库版本,一旦您使用已安装的。如上所述的包函数只是在矩阵的第一维中使用包的名称。

packinfo["RANN",c("Package", "Version")]
packinfo["graphics",c("Package", "Version")]

上面将打印RANN库和图形库的版本。

使用R方法packageDescription获取已安装包的描述,对于版本,只需使用$ version as:

packageDescription("AppliedPredictiveModeling")$Version
[1] "1.1-6"

你可以尝试这样做:

package_version (R.version) getRversion ()

使用如下代码获取系统中安装的R包版本。

installed.packages(fields = c ("Package", "Version"))

GUI解决方案:

如果您正在使用RStudio,那么您可以在Packages窗格中检查包版本。