如何找出在R中加载了哪个包版本?

我正在研究如何使用我的大学集群。它安装了2个R版本。系统范围R 2.11 (Debian 6.0)和R 2.14.2在非标准位置。

我正在尝试使用MPI和雪。我要运行的代码如下所示

library(snow)
library(Rmpi)
cl <- makeMPIcluster(mpi.universe.size()-1)
stopCluster(cl)
mpi.quit()

它在r2.11上没有任何问题。(我用mpirun -H localhost启动脚本，n1,n2,n3,n4 -n 1 R——slave -f code.R)。现在，当我尝试用R 2.14.2来做这件事时，我得到了以下消息:

Error: This is R 2.11.1, package 'snow' needs >= 2.12.1
In addition: Warning message:

所以R似乎加载了为r2.11编译的snow版本包。我已经在r2.14下将snow安装到我的主文件夹中，并在代码中添加了以下代码行:

.libPaths("/soft/R/lib/R/library")
.libPaths("~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.11")
print(.libPaths())
print(sessionInfo())
print(version)

错误之前的输出确认我确实在运行R 2.14.2，我的R packages文件夹在搜索路径的第一个。但我还是得到了错误。

我的问题是，如何确定R中加载的是哪个版本的包?我可以看到安装。包所有的包，其中安装，所以也许有一些功能，列出类似的信息加载包?

当前回答

GUI解决方案:

如果您正在使用RStudio，那么您可以在Packages窗格中检查包版本。

2016-10-17 13:25:08

其他回答

你可以使用utils::packageVersion来查看安装的包的版本:

> packageVersion("snow")
[1] ‘0.3.9’

请注意,

一个包将不会被“找到”，除非它有一个包含有效版本字段的描述文件。当没有找到包目录和有合适的目录但没有有效的DESCRIPTION文件时，会给出不同的警告。

虽然听起来像是你想知道你正在运行的R的哪个版本，但在这种情况下，@Justin的sessionInfo建议是可行的。

2012-06-19 14:36:34

要检查R的版本，执行:R——version

或者在R shell中打印版本$version.string的内容

EDIT

要检查已安装包的版本，请执行以下操作。

加载库之后，可以执行sessionInfo ()

但是要知道所有已安装包的列表:

packinfo <- installed.packages(fields = c("Package", "Version"))
packinfo[,c("Package", "Version")]

或来提取特定的库版本，一旦您使用已安装的。如上所述的包函数只是在矩阵的第一维中使用包的名称。

packinfo["RANN",c("Package", "Version")]
packinfo["graphics",c("Package", "Version")]

上面将打印RANN库和图形库的版本。

2012-06-19 14:32:09

使用如下代码获取系统中安装的R包版本。

installed.packages(fields = c ("Package", "Version"))

2015-09-24 08:07:42

你可以尝试这样做:

package_version (R.version) getRversion ()

2012-09-23 02:22:49

您可以使用sessionInfo()来实现这一点。

> sessionInfo()
R version 2.15.0 (2012-03-30)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8    LC_PAPER=C                 LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] graphics  grDevices utils     datasets  stats     grid      methods   base     

other attached packages:
[1] ggplot2_0.9.0  reshape2_1.2.1 plyr_1.7.1    

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] colorspace_1.1-1   dichromat_1.2-4    digest_0.5.2       MASS_7.3-18        memoise_0.1        munsell_0.3       
 [7] proto_0.3-9.2      RColorBrewer_1.0-5 scales_0.2.0       stringr_0.6       
>

然而，根据下面的评论和答案，有更好的选择

> packageVersion("snow")

[1] '0.3.9'

Or:

"Rmpi" %in% loadedNamespaces()

2012-06-19 14:31:47

如何找出在R中加载了哪个包版本?

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