如何找出在R中加载了哪个包版本?

我正在研究如何使用我的大学集群。它安装了2个R版本。系统范围R 2.11 (Debian 6.0)和R 2.14.2在非标准位置。

我正在尝试使用MPI和雪。我要运行的代码如下所示

library(snow)
library(Rmpi)
cl <- makeMPIcluster(mpi.universe.size()-1)
stopCluster(cl)
mpi.quit()

它在r2.11上没有任何问题。(我用mpirun -H localhost启动脚本，n1,n2,n3,n4 -n 1 R——slave -f code.R)。现在，当我尝试用R 2.14.2来做这件事时，我得到了以下消息:

Error: This is R 2.11.1, package 'snow' needs >= 2.12.1
In addition: Warning message:

所以R似乎加载了为r2.11编译的snow版本包。我已经在r2.14下将snow安装到我的主文件夹中，并在代码中添加了以下代码行:

.libPaths("/soft/R/lib/R/library")
.libPaths("~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.11")
print(.libPaths())
print(sessionInfo())
print(version)

错误之前的输出确认我确实在运行R 2.14.2，我的R packages文件夹在搜索路径的第一个。但我还是得到了错误。

我的问题是，如何确定R中加载的是哪个版本的包?我可以看到安装。包所有的包，其中安装，所以也许有一些功能，列出类似的信息加载包?

当前回答

要补充@GSee的回答，请注意utils::packageVersion()的返回值不是字符，您可以完美地使用它来编写条件:

packageVersion("dplyr")
#> [1] '1.0.7'
packageVersion("dplyr")>1
#> [1] TRUE
packageVersion("dplyr")>'1.0'
#> [1] TRUE
packageVersion("dplyr")>'1.1'
#> [1] FALSE

由reprex包在2021-08-23创建(v2.0.0)

2021-08-23 09:40:52

其他回答

使用R方法packageDescription获取已安装包的描述，对于版本，只需使用$ version as:

packageDescription("AppliedPredictiveModeling")$Version
[1] "1.1-6"

2016-05-14 05:04:44

你可以尝试这样做:

package_version (R.version) getRversion ()

2012-09-23 02:22:49

使用如下代码获取系统中安装的R包版本。

installed.packages(fields = c ("Package", "Version"))

2015-09-24 08:07:42

从技术上讲，目前所有的答案都是错误的。packageVersion不返回加载包的版本。它进入磁盘，并从那里获取包的版本。

这在大多数情况下不会有什么不同，但有时会有。据我所知，获得已加载包版本的唯一方法是:

asNamespace(pkg)$`.__NAMESPACE__.`$spec[["version"]]

其中PKG为包名。

编辑:我不确定这个函数是什么时候添加的，但你也可以使用getNamespaceVersion，这是更干净的:

getNamespaceVersion(pkg)

2016-05-22 00:07:35

你可以使用utils::packageVersion来查看安装的包的版本:

> packageVersion("snow")
[1] ‘0.3.9’

请注意,

一个包将不会被“找到”，除非它有一个包含有效版本字段的描述文件。当没有找到包目录和有合适的目录但没有有效的DESCRIPTION文件时，会给出不同的警告。

虽然听起来像是你想知道你正在运行的R的哪个版本，但在这种情况下，@Justin的sessionInfo建议是可行的。

2012-06-19 14:36:34

如何找出在R中加载了哪个包版本?

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