在Python Pandas中,检查DataFrame是否有一个(或多个)NaN值的最佳方法是什么?

我知道函数pd。isnan,但这将返回每个元素的布尔值的DataFrame。这篇文章也没有完全回答我的问题。


当前回答

你有两个选择。

import pandas as pd
import numpy as np

df = pd.DataFrame(np.random.randn(10,6))
# Make a few areas have NaN values
df.iloc[1:3,1] = np.nan
df.iloc[5,3] = np.nan
df.iloc[7:9,5] = np.nan

现在数据帧看起来是这样的:

          0         1         2         3         4         5
0  0.520113  0.884000  1.260966 -0.236597  0.312972 -0.196281
1 -0.837552       NaN  0.143017  0.862355  0.346550  0.842952
2 -0.452595       NaN -0.420790  0.456215  1.203459  0.527425
3  0.317503 -0.917042  1.780938 -1.584102  0.432745  0.389797
4 -0.722852  1.704820 -0.113821 -1.466458  0.083002  0.011722
5 -0.622851 -0.251935 -1.498837       NaN  1.098323  0.273814
6  0.329585  0.075312 -0.690209 -3.807924  0.489317 -0.841368
7 -1.123433 -1.187496  1.868894 -2.046456 -0.949718       NaN
8  1.133880 -0.110447  0.050385 -1.158387  0.188222       NaN
9 -0.513741  1.196259  0.704537  0.982395 -0.585040 -1.693810

选项1:df.isnull().any().any() -返回一个布尔值

你知道isnull()会返回一个这样的数据框架:

       0      1      2      3      4      5
0  False  False  False  False  False  False
1  False   True  False  False  False  False
2  False   True  False  False  False  False
3  False  False  False  False  False  False
4  False  False  False  False  False  False
5  False  False  False   True  False  False
6  False  False  False  False  False  False
7  False  False  False  False  False   True
8  False  False  False  False  False   True
9  False  False  False  False  False  False

如果你让它df.isnull().any(),你可以找到只有NaN值的列:

0    False
1     True
2    False
3     True
4    False
5     True
dtype: bool

还有一个.any()会告诉你上面的任何一个是否为True

> df.isnull().any().any()
True

选项2:df.isnull().sum().sum() -返回NaN值总数的整数:

它的操作方式与.any().any()相同,首先给出一列中NaN值数量的总和,然后是这些值的总和:

df.isnull().sum()
0    0
1    2
2    0
3    1
4    0
5    2
dtype: int64

最后,要获得DataFrame中NaN值的总数:

df.isnull().sum().sum()
5

其他回答

根据您正在处理的数据类型,您还可以在执行EDA时通过将dropna设置为False来获得每列的值计数。

for col in df:
   print df[col].value_counts(dropna=False)

适用于分类变量,但当你有很多唯一值时就不那么适用了。

由于pandas必须为DataFrame.dropna()找到这一点,我看了看他们是如何实现它的,并发现他们使用了DataFrame.count(),它会计数DataFrame中的所有非空值。参考熊猫源代码。我还没有对这种技术进行基准测试,但我认为库的作者可能已经就如何实现它做出了明智的选择。

只是用 math.isnan(x),如果x是NaN(不是数字)则返回True,否则返回False。

df.isna().any(axis=None)

从v0.23.2开始,您可以使用DataFrame。isna + DataFrame.any(axis=None),其中axis=None指定整个DataFrame的逻辑缩减。

# Setup
df = pd.DataFrame({'A': [1, 2, np.nan], 'B' : [np.nan, 4, 5]})
df
     A    B
0  1.0  NaN
1  2.0  4.0
2  NaN  5.0

df.isna()

       A      B
0  False   True
1  False  False
2   True  False

df.isna().any(axis=None)
# True

有用的替代方案

numpy.isnan 如果您正在运行旧版本的pandas,则另一个性能选项。

np.isnan(df.values)

array([[False,  True],
       [False, False],
       [ True, False]])

np.isnan(df.values).any()
# True

或者,检查和:

np.isnan(df.values).sum()
# 2

np.isnan(df.values).sum() > 0
# True

Series.hasnans 你也可以迭代地调用Series.hasnans。例如,要检查单个列是否有nan,

df['A'].hasnans
# True

要检查任何列是否具有nan,可以对any使用推导式(这是一种短路操作)。

any(df[c].hasnans for c in df)
# True

这实际上非常快。

试试下面的方法

df.isnull().sum()

or

df.isna().values.any()