另一种选择是转换数据，以减轻异常值的影响。你可以通过winsorize你的数据来做到这一点。

import pandas as pd
from scipy.stats import mstats
%matplotlib inline

test_data = pd.Series(range(30))
test_data.plot()

# Truncate values to the 5th and 95th percentiles
transformed_test_data = pd.Series(mstats.winsorize(test_data, limits=[0.05, 0.05])) 
transformed_test_data.plot()

你可以使用布尔掩码:

import pandas as pd

def remove_outliers(df, q=0.05):
    upper = df.quantile(1-q)
    lower = df.quantile(q)
    mask = (df < upper) & (df > lower)
    return mask

t = pd.DataFrame({'train': [1,1,2,3,4,5,6,7,8,9,9],
                  'y': [1,0,0,1,1,0,0,1,1,1,0]})

mask = remove_outliers(t['train'], 0.1)

print(t[mask])

输出:

   train  y
2      2  0
3      3  1
4      4  1
5      5  0
6      6  0
7      7  1
8      8  1

这个答案类似于@tanemaki提供的答案，但使用了lambda表达式而不是scipy stats。

df = pd.DataFrame(np.random.randn(100, 3), columns=list('ABC'))

standard_deviations = 3
df[df.apply(lambda x: np.abs(x - x.mean()) / x.std() < standard_deviations)
   .all(axis=1)]

要过滤只有一个列的数据帧(例如:B)在三个标准差之内:

df[((df['B'] - df['B'].mean()) / df['B'].std()).abs() < standard_deviations]

关于如何在滚动的基础上应用这个z-score:滚动z-score应用于pandas数据框架

我认为删除和删除异常值在统计上是错误的。 它使数据不同于原始数据。 也使得数据的形状不均匀，因此最好的方法是通过对数据进行对数变换来减少或避免异常值的影响。 这招对我很管用:

np.log(data.iloc[:, :])

把98和2百分位作为离群值的极限

upper_limit = np.percentile(X_train.logerror.values, 98) 
lower_limit = np.percentile(X_train.logerror.values, 2) # Filter the outliers from the dataframe
data[‘target’].loc[X_train[‘target’]>upper_limit] = upper_limit data[‘target’].loc[X_train[‘target’]<lower_limit] = lower_limit

由于我还没有看到处理数值和非数值属性的答案，这里有一个补充答案。

您可能只希望删除数值属性上的异常值(类别变量几乎不可能是异常值)。

函数定义

我扩展了@tanemaki的建议，当非数值属性也存在时处理数据:

from scipy import stats

def drop_numerical_outliers(df, z_thresh=3):
    # Constrains will contain `True` or `False` depending on if it is a value below the threshold.
    constrains = df.select_dtypes(include=[np.number]) \
        .apply(lambda x: np.abs(stats.zscore(x)) < z_thresh, reduce=False) \
        .all(axis=1)
    # Drop (inplace) values set to be rejected
    df.drop(df.index[~constrains], inplace=True)

使用

drop_numerical_outliers(df)

例子

想象一个数据集df，其中包含一些关于房屋的值:小巷、土地轮廓、销售价格……例:数据文档

首先，你想要在散点图上可视化数据(z-score Thresh=3):

# Plot data before dropping those greater than z-score 3. 
# The scatterAreaVsPrice function's definition has been removed for readability's sake.
scatterAreaVsPrice(df)

# Drop the outliers on every attributes
drop_numerical_outliers(train_df)

# Plot the result. All outliers were dropped. Note that the red points are not
# the same outliers from the first plot, but the new computed outliers based on the new data-frame.
scatterAreaVsPrice(train_df)