我有一个很少列的熊猫数据帧。

现在我知道某些行是基于某个列值的异常值。

例如

列“Vol”的所有值都在12xx左右,其中一个值是4000(离群值)。

现在我想排除那些Vol列像这样的行。

所以,本质上,我需要在数据帧上放一个过滤器,这样我们就可以选择所有的行,其中某一列的值距离平均值在3个标准差之内。

实现这一点的优雅方式是什么?


当前回答

另一种选择是转换数据,以减轻异常值的影响。你可以通过winsorize你的数据来做到这一点。

import pandas as pd
from scipy.stats import mstats
%matplotlib inline

test_data = pd.Series(range(30))
test_data.plot()

# Truncate values to the 5th and 95th percentiles
transformed_test_data = pd.Series(mstats.winsorize(test_data, limits=[0.05, 0.05])) 
transformed_test_data.plot()

其他回答

对于你的每一个数据帧列,你可以得到分位数:

q = df["col"].quantile(0.99)

然后用:

df[df["col"] < q]

如果需要移除上下异常值,将condition与and语句结合:

q_low = df["col"].quantile(0.01)
q_hi  = df["col"].quantile(0.99)

df_filtered = df[(df["col"] < q_hi) & (df["col"] > q_low)]

如果你的数据帧有异常值,有很多方法可以处理这些异常值:

大多数都在我的文章中提到过:读一读

在这里找到代码:Notebook

scipy。Stats有方法trim1()和trimboth(),根据排名和被删除值的引入百分比,在单行中删除异常值。

由于我还没有看到处理数值和非数值属性的答案,这里有一个补充答案。

您可能只希望删除数值属性上的异常值(类别变量几乎不可能是异常值)。

函数定义

我扩展了@tanemaki的建议,当非数值属性也存在时处理数据:

from scipy import stats

def drop_numerical_outliers(df, z_thresh=3):
    # Constrains will contain `True` or `False` depending on if it is a value below the threshold.
    constrains = df.select_dtypes(include=[np.number]) \
        .apply(lambda x: np.abs(stats.zscore(x)) < z_thresh, reduce=False) \
        .all(axis=1)
    # Drop (inplace) values set to be rejected
    df.drop(df.index[~constrains], inplace=True)

使用

drop_numerical_outliers(df)

例子

想象一个数据集df,其中包含一些关于房屋的值:小巷、土地轮廓、销售价格……例:数据文档

首先,你想要在散点图上可视化数据(z-score Thresh=3):

# Plot data before dropping those greater than z-score 3. 
# The scatterAreaVsPrice function's definition has been removed for readability's sake.
scatterAreaVsPrice(df)

# Drop the outliers on every attributes
drop_numerical_outliers(train_df)

# Plot the result. All outliers were dropped. Note that the red points are not
# the same outliers from the first plot, but the new computed outliers based on the new data-frame.
scatterAreaVsPrice(train_df)

去掉离群值的函数

def drop_outliers(df, field_name):
    distance = 1.5 * (np.percentile(df[field_name], 75) - np.percentile(df[field_name], 25))
    df.drop(df[df[field_name] > distance + np.percentile(df[field_name], 75)].index, inplace=True)
    df.drop(df[df[field_name] < np.percentile(df[field_name], 25) - distance].index, inplace=True)