我有一个很少列的熊猫数据帧。
现在我知道某些行是基于某个列值的异常值。
例如
列“Vol”的所有值都在12xx左右,其中一个值是4000(离群值)。
现在我想排除那些Vol列像这样的行。
所以,本质上,我需要在数据帧上放一个过滤器,这样我们就可以选择所有的行,其中某一列的值距离平均值在3个标准差之内。
实现这一点的优雅方式是什么?
我有一个很少列的熊猫数据帧。
现在我知道某些行是基于某个列值的异常值。
例如
列“Vol”的所有值都在12xx左右,其中一个值是4000(离群值)。
现在我想排除那些Vol列像这样的行。
所以,本质上,我需要在数据帧上放一个过滤器,这样我们就可以选择所有的行,其中某一列的值距离平均值在3个标准差之内。
实现这一点的优雅方式是什么?
当前回答
另一种选择是转换数据,以减轻异常值的影响。你可以通过winsorize你的数据来做到这一点。
import pandas as pd
from scipy.stats import mstats
%matplotlib inline
test_data = pd.Series(range(30))
test_data.plot()
# Truncate values to the 5th and 95th percentiles
transformed_test_data = pd.Series(mstats.winsorize(test_data, limits=[0.05, 0.05]))
transformed_test_data.plot()
其他回答
#------------------------------------------------------------------------------
# accept a dataframe, remove outliers, return cleaned data in a new dataframe
# see http://www.itl.nist.gov/div898/handbook/prc/section1/prc16.htm
#------------------------------------------------------------------------------
def remove_outlier(df_in, col_name):
q1 = df_in[col_name].quantile(0.25)
q3 = df_in[col_name].quantile(0.75)
iqr = q3-q1 #Interquartile range
fence_low = q1-1.5*iqr
fence_high = q3+1.5*iqr
df_out = df_in.loc[(df_in[col_name] > fence_low) & (df_in[col_name] < fence_high)]
return df_out
把98和2百分位作为离群值的极限
upper_limit = np.percentile(X_train.logerror.values, 98)
lower_limit = np.percentile(X_train.logerror.values, 2) # Filter the outliers from the dataframe
data[‘target’].loc[X_train[‘target’]>upper_limit] = upper_limit data[‘target’].loc[X_train[‘target’]<lower_limit] = lower_limit
另一种选择是转换数据,以减轻异常值的影响。你可以通过winsorize你的数据来做到这一点。
import pandas as pd
from scipy.stats import mstats
%matplotlib inline
test_data = pd.Series(range(30))
test_data.plot()
# Truncate values to the 5th and 95th percentiles
transformed_test_data = pd.Series(mstats.winsorize(test_data, limits=[0.05, 0.05]))
transformed_test_data.plot()
这个答案类似于@tanemaki提供的答案,但使用了lambda表达式而不是scipy stats。
df = pd.DataFrame(np.random.randn(100, 3), columns=list('ABC'))
standard_deviations = 3
df[df.apply(lambda x: np.abs(x - x.mean()) / x.std() < standard_deviations)
.all(axis=1)]
要过滤只有一个列的数据帧(例如:B)在三个标准差之内:
df[((df['B'] - df['B'].mean()) / df['B'].std()).abs() < standard_deviations]
关于如何在滚动的基础上应用这个z-score:滚动z-score应用于pandas数据框架
由于我正处于我的数据科学之旅的早期阶段,我使用下面的代码来处理异常值。
#Outlier Treatment
def outlier_detect(df):
for i in df.describe().columns:
Q1=df.describe().at['25%',i]
Q3=df.describe().at['75%',i]
IQR=Q3 - Q1
LTV=Q1 - 1.5 * IQR
UTV=Q3 + 1.5 * IQR
x=np.array(df[i])
p=[]
for j in x:
if j < LTV or j>UTV:
p.append(df[i].median())
else:
p.append(j)
df[i]=p
return df