从git中删除子模块的最佳方法：

$ git submodule deinit -f <submodule-name>
$ rm -rf .git/modules/<submodule-name>
$ git config -f .gitmodules --remove-section submodule.<submodule-name>
$ git config -f .git/config --remove-section submodule.<submodule-name>
$ git rm --cached <submodule-name>
$ git commit -m 'rm submodule: <submodule-name>'

我刚刚找到了.submodule（忘记了确切名称）隐藏文件，它有一个列表。。。你可以用这种方式逐个删除它们。我刚刚有一个，所以我删除了它。很简单，但它可能会搞乱Git，因为我不知道子模块是否附加了什么。到目前为止，除了libetpan通常的升级问题外，似乎还可以，但这（希望）是无关的。

注意到没有人发布手动擦除，因此添加

只是一张纸条。从git1.8.5.2开始，有两个命令可以执行：

git rm -r the_submodule
rm -rf .git/modules/the_submodule

正如@Mark Cheverton的回答正确指出的那样，如果没有使用第二行，即使您现在删除了子模块，剩余的.git/modules/the_submodule文件夹也将阻止将来添加或替换相同的子模块。此外，正如@VonC所提到的，gitrm将在子模块上完成大部分工作。

--更新（07/05/2017）--

为了澄清，_submodule是项目中子模块的相对路径。例如，如果子模块位于子目录subdir内，则为subdir/my_submodule。

正如评论和其他答案中正确指出的，这两个命令（虽然功能上足以删除子模块）确实在.git/config的[submodule“the_submodule”]部分留下了痕迹（截至2017年7月），可以使用第三个命令删除：

git config -f .git/config --remove-section submodule.the_submodule 2> /dev/null

我不得不进一步执行John Douth的步骤，并将其cd到子模块的目录中，然后删除Git存储库：

cd submodule
rm -fr .git

然后，我可以将文件作为父Git存储库的一部分提交，而无需对子模块的旧引用。

project dir:     ~/foo_project/
submodule:       ~/foo_project/lib/asubmodule
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
run:
  1.   cd ~/foo_project
  2.   git rm lib/asubmodule && 
          rm .git/modules/lib/asubmodule && 
            git submodule lib/asubmodule deinit --recursive --force

以下是我认为必要或有用的4个步骤（首先是重要步骤）：

git rm -f the_submodule
rm -rf .git/modules/the_submodule
git config -f .git/config --remove-section submodule.the_submodule
git commit -m "..."

理论上，第1步中的git rm应该处理它。希望OP问题的第二部分有一天能够得到肯定的回答（这可以在一个命令中完成）。

但从2017年7月起，第2步必须删除.git/modules/中的数据。否则，您不能在将来重新添加子模块。

正如tinlyx的回答所指出的那样，您可能可以省去上面的两个git1.8.5+步骤，因为所有的git子模块命令似乎都有效。

步骤3删除了.git/config文件中_submodule的部分。为了完整起见，应该这样做。（该条目可能会对较旧的git版本造成问题，但我没有要测试的条目）。

为此，大多数答案建议使用git子模块deinit。我发现使用git-config-f.git/config--remove部分更加明确，也不那么令人困惑。根据git子模块文档，git deinit：

注销给定的子模块。。。如果确实要删除存储库中的子模块，并使用gitrm[1]提交相反

最后但并非最不重要的是，如果您没有gitcommit，那么在执行git子模块摘要时（从git2.7开始），您可能会遇到错误：

fatal: Not a git repository: 'the_submodule/.git'
* the_submodule 73f0d1d...0000000:

这与执行步骤2或3无关。