最近我似乎和合作者分享了很多代码。他们中的许多人是新手/中级R用户,并没有意识到他们必须安装他们还没有的包。
是否有一种优雅的方式来调用installed.packages(),比较那些我正在加载和安装如果丢失?
最近我似乎和合作者分享了很多代码。他们中的许多人是新手/中级R用户,并没有意识到他们必须安装他们还没有的包。
是否有一种优雅的方式来调用installed.packages(),比较那些我正在加载和安装如果丢失?
当前回答
使用lapply族和匿名函数方法,您可以:
尝试附加所有列出的包。 仅安装缺失(使用||惰性计算)。 尝试再次连接那些在第1步中丢失并在第2步中安装的组件。 打印每个包的最终加载状态(TRUE / FALSE)。 Req <- substitute(require(x, character。only = TRUE)) LBS <- c("plyr", "psych", "tm") Sapply (lbs, function(x) eval(req) || {install.packages(x);eval(点播)}) 心理学 真真真真
其他回答
让我分享一点疯狂:
c("ggplot2","ggsci", "hrbrthemes", "gghighlight", "dplyr") %>% # What will you need to load for this script?
(function (x) ifelse(t =!(x %in% installed.packages()),
install.packages(x[t]),
lapply(x, require)))
上面的许多答案(以及这个问题的副本)依赖于安装。包装是不好的形式。从文档中可以看到:
当安装了数千个包时,这可能会很慢,所以不要使用它来查找是否安装了指定的包(使用system. exe)。或者查找一个包是否可用(调用require并检查返回值),或者查找少量包的详细信息(使用packageDescription)。每个安装的包需要读取几个文件,这在Windows和一些网络挂载的文件系统上会很慢。
因此,更好的方法是尝试使用require和install加载包,如果加载失败(如果没有找到require将返回FALSE)。我更喜欢这样的实现:
using<-function(...) {
libs<-unlist(list(...))
req<-unlist(lapply(libs,require,character.only=TRUE))
need<-libs[req==FALSE]
if(length(need)>0){
install.packages(need)
lapply(need,require,character.only=TRUE)
}
}
可以这样使用:
using("RCurl","ggplot2","jsonlite","magrittr")
通过这种方式,它加载所有的包,然后返回并安装所有丢失的包(如果您愿意,可以在这里插入提示,询问用户是否想要安装包)。而不是调用install。对于每个包,它只传递一次卸载包的整个向量。
下面是相同的函数,但是有一个窗口对话框,询问用户是否想要安装缺少的包
using<-function(...) {
libs<-unlist(list(...))
req<-unlist(lapply(libs,require,character.only=TRUE))
need<-libs[req==FALSE]
n<-length(need)
if(n>0){
libsmsg<-if(n>2) paste(paste(need[1:(n-1)],collapse=", "),",",sep="") else need[1]
print(libsmsg)
if(n>1){
libsmsg<-paste(libsmsg," and ", need[n],sep="")
}
libsmsg<-paste("The following packages could not be found: ",libsmsg,"\n\r\n\rInstall missing packages?",collapse="")
if(winDialog(type = c("yesno"), libsmsg)=="YES"){
install.packages(need)
lapply(need,require,character.only=TRUE)
}
}
}
非常基本的一个。
pkgs = c("pacman","data.table")
if(length(new.pkgs <- setdiff(pkgs, rownames(installed.packages())))) install.packages(new.pkgs)
今天,我偶然发现了rlang包提供的两个方便函数,即is_installed()和check_installed()。
从帮助页面(强调添加):
These functions check that packages are installed with minimal side effects. If installed, the packages will be loaded but not attached. is_installed() doesn't interact with the user. It simply returns TRUE or FALSE depending on whether the packages are installed. In interactive sessions, check_installed() asks the user whether to install missing packages. If the user accepts, the packages are installed [...]. If the session is non interactive or if the user chooses not to install the packages, the current evaluation is aborted.
interactive()
#> [1] FALSE
rlang::is_installed(c("dplyr"))
#> [1] TRUE
rlang::is_installed(c("foobarbaz"))
#> [1] FALSE
rlang::check_installed(c("dplyr"))
rlang::check_installed(c("foobarbaz"))
#> Error:
#> ! The package `foobarbaz` is required.
由reprex包在2022-03-25创建(v2.0.1)
下面是我的代码:
packages <- c("dplyr", "gridBase", "gridExtra")
package_loader <- function(x){
for (i in 1:length(x)){
if (!identical((x[i], installed.packages()[x[i],1])){
install.packages(x[i], dep = TRUE)
} else {
require(x[i], character.only = TRUE)
}
}
}
package_loader(packages)