最近我似乎和合作者分享了很多代码。他们中的许多人是新手/中级R用户，并没有意识到他们必须安装他们还没有的包。
是否有一种优雅的方式来调用installed.packages()，比较那些我正在加载和安装如果丢失?
当前回答
当前版本的RStudio(>=1.2)包含了一个功能，可以检测library()和require()调用中缺失的包，并提示用户安装它们:
检测丢失的R包 许多R脚本打开时调用library()和require()来加载执行所需的包。如果您打开一个R脚本，该脚本引用了您没有安装的包，RStudio现在将提供一次单击即可安装所有所需的包。不再重复输入install.packages()，直到错误消失! https://blog.rstudio.com/2018/11/19/rstudio-1-2-preview-the-little-things/
这似乎很好地解决了OP最初的问题:
他们中的许多人是新手/中级R用户，并没有意识到他们必须安装他们还没有的包。
其他回答
当前版本的RStudio(>=1.2)包含了一个功能，可以检测library()和require()调用中缺失的包，并提示用户安装它们:
检测丢失的R包 许多R脚本打开时调用library()和require()来加载执行所需的包。如果您打开一个R脚本，该脚本引用了您没有安装的包，RStudio现在将提供一次单击即可安装所有所需的包。不再重复输入install.packages()，直到错误消失! https://blog.rstudio.com/2018/11/19/rstudio-1-2-preview-the-little-things/
这似乎很好地解决了OP最初的问题:
他们中的许多人是新手/中级R用户，并没有意识到他们必须安装他们还没有的包。
达森·k和我有一个吃豆人包可以很好地做到这一点。包中的p_load函数执行此操作。第一行代码只是为了确保安装了pacman。
if (!require("pacman")) install.packages("pacman")
pacman::p_load(package1, package2, package_n)
packages_installed <- function(pkg_list){
pkgs <- unlist(pkg_list)
req <- unlist(lapply(pkgs, require, character.only = TRUE))
not_installed <- pkgs[req == FALSE]
lapply(not_installed, install.packages,
repos = "http://cran.r-project.org")# add lib.loc if needed
lapply(pkgs, library, character.only = TRUE)
}
pckg=c("shiny","ggplot2","dplyr","leaflet","lubridate","RColorBrewer","plotly","DT","shinythemes")
for(i in 1:length(pckg))
{
print(pckg[i])
if (!is.element(pckg[i], installed.packages()[,1]))
install.packages(pckg[i], dep = TRUE)
require(pckg[i], character.only = TRUE)
}
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
if (!require("ggsci")) biocLite("ggsci")
