编译首先，编译是有区别的。网站不是在服务器上预编译的，而是在文件上编译的。可能是这是一个优势，因为当您想要更改Web中的某些内容时站点您只需从服务器下载一个特定的文件，更改它并把这个文件上传回服务器，一切都会正常。在Web中应用程序无法执行此操作，因为所有内容都是预编译的你最终只有一个dll。当您更改一个文件中的内容时您的项目必须重新编译所有内容。所以如果你愿意希望能够更改服务器上的某些文件。网站是更好的解决方案。它还允许许多开发人员开发一个网站。另一方面，如果您不希望代码您应该选择Web应用程序。这选项对于单元测试也更好，因为一个DLL文件在发布网站后创建。

项目结构项目的结构也存在差异。在Web应用程序中，您有一个项目文件，就像在普通应用程序中一样。在网站中，并没有传统的项目文件，只有解决方案文件。所有引用和设置都存储在web.config文件中。@Page指令对于包含与此页面关联的类的文件，@Page指令中有一个不同的属性。在Web应用程序中，它是标准的“CodeBehind”，在Web站点中使用“CodeFile”。您可以在以下示例中看到这一点：

Web应用程序：

<%@ Page Language="C#" AutoEventWireup="true" CodeBehind="Default.aspx.cs"  
Inherits="WebApplication._Default" %>  

网站：

<%@ Page Language="C#" AutoEventWireup="true" CodeFile="Default.aspx.cs" Inherits="_Default" %> 

命名空间-在上面的示例中，您还可以看到另一个区别-如何创建命名空间。In-Web Application命名空间只是一个项目名称。在网站中有默认的命名空间ASP动态编译页面。编辑并继续-在Web应用程序中，“编辑并继续”选项为可用（要打开它，必须转到“工具”菜单，单击“选项”然后在调试中找到“编辑并继续”）。此功能不起作用在Web Site.ASP.NET MVCI中，如果要使用ASP.NET MVC（模型视图控制器）最佳和默认选项是Web应用程序。尽管可以在Web站点中使用MVC不建议使用。摘要-ASP.NET Web应用程序之间最重要的区别网站是编译。所以如果你在一个更大的项目上工作少数人可以修改它，最好使用网站。但如果你是做一个较小的项目，您也可以使用Web应用程序。

这取决于你在发展什么。

一个以内容为导向的网站会经常改变其内容，而网站更适合于此。

应用程序倾向于将其数据存储在数据库中，其页面和代码很少更改。在这种情况下，最好有一个Web应用程序，其中程序集的部署更受控制，并且更好地支持单元测试。

这始终取决于客户的要求。ASP.NET仅包含用户需要的灵活功能，以确保应用程序的安全性和易于维护。

您可以将Web应用程序视为在ASP.NET框架内运行的二进制文件。网站是一个静态网页，您可以查看并轻松部署源代码。

但这两种ASP.NET技术的优点和缺点都是好的。

总结以上一些答案：

灵活性，您可以对网页进行实时更改吗？

网站：可能。赞成：短期利益。缺点：项目混乱的长期风险。

Web应用程序：不可能。编辑页面，将更改存档到源代码管理，然后构建和部署整个站点。专业：保持高质量的项目。

发展问题

网站：没有.csproj文件的简单项目结构。两个.aspx页面可以具有相同的类名，而不会发生冲突。随机项目目录名导致生成错误，如为什么.net框架与自己生成的文件冲突，以及为什么.net框架与其自己生成的文档冲突。专业人士：简单（简单化）。缺点：不稳定。

Web应用程序：项目结构类似于WebForms项目，具有.csproj文件。asp页面的类名必须是唯一的。专业：简单（智能）。缺点：没有，因为网络应用程序仍然很简单。

Web应用程序需要更多的内存，可能是因为您别无选择，只能编译成一个程序集。我刚刚将一个大型遗留站点转换为web应用程序，在编译时内存不足，错误消息如下：

Unexpected error writing metadata to file '' -- 
Not enough storage is available to complete this operation. 

错误，并在运行时显示以下错误消息：

Exception information: 
    Exception type: HttpException 
    Exception message: Exception of type 'System.OutOfMemoryException' was thrown.
   at System.Web.Compilation.BuildManager.ReportTopLevelCompilationException()

我对在内存受限的传统硬件上转换大型站点的建议是，选择恢复到网站模型的选项。即使在最初的成功之后，问题也可能会在以后慢慢出现。

绝对是web应用程序，单个DLL文件，易于维护。但网站更灵活；您可以随时编辑aspx文件。