网站=当网站由图形设计师创建且程序员仅编辑一到两页时使用

Web应用程序=当应用程序由程序员创建且图形设计师仅编辑一页或两页/图像时使用。

网站可以使用任何HTML工具进行工作，而不必使用开发人员工作室，因为项目文件不需要更新等。当团队主要使用开发人员studio并且代码内容较高时，Web应用程序是最佳的。

（某些编码错误在编译时在Web应用程序中发现，直到运行时才在Web站点中发现。）

警告：我多年前就写过这个答案，之后就再也没有使用Asp.net了。我想事情已经开始了。

网站和Project>>网站是使用visual studio创建ASP.NET应用程序的两种不同方法。一个是无项目的，另一个是项目环境。差异如下

解决方案文件存储在项目环境中与根目录相同的目录中。在项目环境中部署之前，需要删除解决方案和项目文件。完整的根目录部署在无项目环境中。

使用这两种方法都没有太大的基本区别。但如果您创建的网站需要更长的时间，请选择项目环境。

WebSite：它会自动生成app_code文件夹，如果您在服务器上发布它，然后如果您对任何特定文件或页面进行一些更改，则不必编译所有文件。

Web应用程序它自动生成网站不生成的解决方案文件，如果您在一个文件中进行更改，则必须编译整个项目以反映其更改。

网站：

网站项目是动态编译的。你最终会得到更多的DLL文件，这可能是一件痛苦的事。当一个目录中的页面或控件需要引用另一个目录的页面和控件时，这也会带来问题，因为其他目录可能尚未编译到代码中。另一个问题可能是出版。

如果Visual Studio没有被告知要经常重复使用相同的名称，它将为页面始终生成的DLL文件提供新名称。这可能导致具有包含相同类名的DLL文件的多个紧密副本，这将产生大量误差。网站项目是在VisualStudio2005中引入的，但事实证明它并不流行。

Web应用程序：

Web应用程序项目是作为外接程序创建的，现在作为一部分存在Visual Studio 2005的SP 1。主要区别在于Web应用程序项目设计为与Visual Studio 2003附带的Web项目类似。它将在构建时将应用程序编译为单个DLL文件时间若要更新项目，必须重新编译该项目，并且DLL文件发布以进行更改。

Web应用程序的另一个好特性从项目视图中排除文件要容易得多。在网站项目，您排除的每个文件都将重命名为文件名中的关键字。在Web应用程序项目中跟踪项目视图中要包含/排除的文件重新命名它们，使事情更加整洁。

参考

ASP.NET 2.0-网站与Web应用程序项目这篇文章也给出了为什么使用其中一个而不是另一个的原因。以下是摘录：

您需要将大型Visual Studio.NET 2003应用程序迁移到VS2005? 使用Web应用程序项目。您希望将任何目录作为Web项目打开和编辑，而不需要创建项目文件？使用网站项目您需要在编译期间添加预编译和后编译步骤吗？使用Web应用程序项目。您需要使用多个Web构建Web应用程序项目？使用Web应用程序项目。是否要为每个页面生成一个程序集？使用网站项目。您更喜欢动态编译和在不构建的情况下处理页面每个页面视图上的整个站点？使用Web现场项目。您更喜欢单页代码模型而不是代码隐藏模型？使用网站项目

Web应用程序项目与Web站点项目（MSDN）解释了Web站点和Web应用程序之间的差异。此外，它还讨论了在Visual Studio中进行的配置。

“网站”的代码位于一个特殊的App_code目录中，并且在运行时被编译为多个DLL（程序集）。“web应用程序”被预编译为一个DLL。

除非您特别需要动态编译的项目，否则不要使用网站项目。

为什么？因为当你试图改变或理解你的项目时，网站项目会把你逼疯。Visual Studio中的静态类型查找功能（例如查找用法、重构）将永远适用于任何大小合理的项目。有关详细信息，请参阅Visual Studio中的堆栈溢出问题慢速“查找所有引用”。

我真的看不出他们为什么会放弃Visual Studio 2005中的web应用程序，因为它是一种令人痛苦、精神错乱、效率低下的网站项目类型。