背景

我刚刚把我的熊猫从0.11升级到0.13.0rc1。现在,应用程序弹出了许多新的警告。其中一个是这样的:

E:\FinReporter\FM_EXT.py:449: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_index,col_indexer] = value instead
  quote_df['TVol']   = quote_df['TVol']/TVOL_SCALE

我想知道这到底是什么意思?我需要改变什么吗?

如果我坚持使用quote_df['TVol'] = quote_df['TVol']/TVOL_SCALE,我应该如何暂停警告?

给出错误的函数

def _decode_stock_quote(list_of_150_stk_str):
    """decode the webpage and return dataframe"""

    from cStringIO import StringIO

    str_of_all = "".join(list_of_150_stk_str)

    quote_df = pd.read_csv(StringIO(str_of_all), sep=',', names=list('ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZabcdefg')) #dtype={'A': object, 'B': object, 'C': np.float64}
    quote_df.rename(columns={'A':'STK', 'B':'TOpen', 'C':'TPCLOSE', 'D':'TPrice', 'E':'THigh', 'F':'TLow', 'I':'TVol', 'J':'TAmt', 'e':'TDate', 'f':'TTime'}, inplace=True)
    quote_df = quote_df.ix[:,[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31]]
    quote_df['TClose'] = quote_df['TPrice']
    quote_df['RT']     = 100 * (quote_df['TPrice']/quote_df['TPCLOSE'] - 1)
    quote_df['TVol']   = quote_df['TVol']/TVOL_SCALE
    quote_df['TAmt']   = quote_df['TAmt']/TAMT_SCALE
    quote_df['STK_ID'] = quote_df['STK'].str.slice(13,19)
    quote_df['STK_Name'] = quote_df['STK'].str.slice(21,30)#.decode('gb2312')
    quote_df['TDate']  = quote_df.TDate.map(lambda x: x[0:4]+x[5:7]+x[8:10])
    
    return quote_df

更多错误消息

E:\FinReporter\FM_EXT.py:449: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_index,col_indexer] = value instead
  quote_df['TVol']   = quote_df['TVol']/TVOL_SCALE
E:\FinReporter\FM_EXT.py:450: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_index,col_indexer] = value instead
  quote_df['TAmt']   = quote_df['TAmt']/TAMT_SCALE
E:\FinReporter\FM_EXT.py:453: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_index,col_indexer] = value instead
  quote_df['TDate']  = quote_df.TDate.map(lambda x: x[0:4]+x[5:7]+x[8:10])

当前回答

由于这个问题已经在现有的答案中得到了充分的解释和讨论,因此我将提供一种简洁的使用pandas的上下文管理器方法。Option_context(链接到文档和示例)-绝对没有必要创建一个带有所有dunder方法和其他花哨功能的自定义类。

首先是上下文管理器代码本身:

from contextlib import contextmanager

@contextmanager
def SuppressPandasWarning():
    with pd.option_context("mode.chained_assignment", None):
        yield

然后是一个例子:

import pandas as pd
from string import ascii_letters

a = pd.DataFrame({"A": list(ascii_letters[0:4]), "B": range(0,4)})

mask = a["A"].isin(["c", "d"])
# Even shallow copy below is enough to not raise the warning, but why is a mystery to me.
b = a.loc[mask]  # .copy(deep=False)

# Raises the `SettingWithCopyWarning`
b["B"] = b["B"] * 2

# Does not!
with SuppressPandasWarning():
    b["B"] = b["B"] * 2

值得注意的是,这两种方法都不修改a,这让我有点惊讶,即使是带有.copy(deep=False)的浅df复制也会防止引发这个警告(据我所知,浅复制至少也应该修改a,但它没有。熊猫魔法)。

其他回答

创建SettingWithCopyWarning是为了标记可能令人困惑的“链式”赋值,例如下面的赋值,它并不总是像预期的那样工作,特别是当第一个选择返回一个副本时。[背景讨论见GH5390和GH5597。]

df[df['A'] > 2]['B'] = new_val  # new_val not set in df

该警告提供了重写建议如下:

df.loc[df['A'] > 2, 'B'] = new_val

然而,这并不符合你的用法,这相当于:

df = df[df['A'] > 2]
df['B'] = new_val

虽然很明显,您并不关心写入操作是否使其返回到原始帧(因为您正在覆盖对它的引用),但不幸的是,此模式无法与第一个链式赋值示例区分开来。因此出现了(假阳性)警告。如果您想进一步阅读,在索引文档中讨论了假阳性的可能性。您可以使用以下赋值安全地禁用此新警告。

import pandas as pd
pd.options.mode.chained_assignment = None  # default='warn'

其他资源

pandas用户指南:索引和选择数据 Python数据科学手册:数据索引和选择 真正的Python: SettingWithCopyWarning在Pandas:视图vs副本 Dataquest: SettingwithCopyWarning:如何修复此警告在熊猫 走向数据科学:解释熊猫中copywarning的设置

当我使用.query()方法从一个预先存在的数据框架分配一个新的数据框架时,我已经得到了这个问题。apply()。例如:

prop_df = df.query('column == "value"')
prop_df['new_column'] = prop_df.apply(function, axis=1)

会返回这个错误。在这种情况下,解决错误的修复方法是将其更改为:

prop_df = df.copy(deep=True)
prop_df = prop_df.query('column == "value"')
prop_df['new_column'] = prop_df.apply(function, axis=1)

然而,这并不是有效的,特别是当使用大数据帧时,因为必须创建一个新的副本。

如果你正在使用.apply()方法来生成一个新的列及其值,解决这个错误并且更有效的修复方法是添加.reset_index(drop=True):

prop_df = df.query('column == "value"').reset_index(drop=True)
prop_df['new_column'] = prop_df.apply(function, axis=1)

由于这个问题已经在现有的答案中得到了充分的解释和讨论,因此我将提供一种简洁的使用pandas的上下文管理器方法。Option_context(链接到文档和示例)-绝对没有必要创建一个带有所有dunder方法和其他花哨功能的自定义类。

首先是上下文管理器代码本身:

from contextlib import contextmanager

@contextmanager
def SuppressPandasWarning():
    with pd.option_context("mode.chained_assignment", None):
        yield

然后是一个例子:

import pandas as pd
from string import ascii_letters

a = pd.DataFrame({"A": list(ascii_letters[0:4]), "B": range(0,4)})

mask = a["A"].isin(["c", "d"])
# Even shallow copy below is enough to not raise the warning, but why is a mystery to me.
b = a.loc[mask]  # .copy(deep=False)

# Raises the `SettingWithCopyWarning`
b["B"] = b["B"] * 2

# Does not!
with SuppressPandasWarning():
    b["B"] = b["B"] * 2

值得注意的是,这两种方法都不修改a,这让我有点惊讶,即使是带有.copy(deep=False)的浅df复制也会防止引发这个警告(据我所知,浅复制至少也应该修改a,但它没有。熊猫魔法)。

熊猫数据帧拷贝警告

当你这样做的时候:

quote_df = quote_df.ix[:,[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31]]

熊猫。在这种情况下,Ix返回一个新的、独立的数据框架。

任何你决定在这个数据框架中改变的值,都不会改变原始数据框架。

这就是熊猫想要警告你的。


为什么。ix是个坏主意

.ix对象试图做不止一件事,对于任何读过干净代码的人来说,这是一种强烈的气味。

给定这个数据框架:

df = pd.DataFrame({"a": [1,2,3,4], "b": [1,1,2,2]})

两个行为:

dfcopy = df.ix[:,["a"]]
dfcopy.a.ix[0] = 2

行为一:dfcopy现在是一个独立的数据框架。改变它不会改变df

df.ix[0, "a"] = 3

行为二:这将改变原始的数据框架。


请改用.loc

pandas开发人员意识到.ix对象很臭(推测性的),因此创建了两个新对象来帮助添加和分配数据。(另一个是。iloc)

.loc更快,因为它不尝试创建数据的副本。

.loc的目的是修改现有的数据帧,这是更有效的内存。

.loc是可预测的,它有一个行为。


解决方案

您在代码示例中所做的是加载一个包含许多列的大文件,然后将其修改为较小的文件。

pd。Read_csv函数可以帮助您解决这些问题,并使文件的加载速度更快。

所以不这样做

quote_df = pd.read_csv(StringIO(str_of_all), sep=',', names=list('ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZabcdefg')) #dtype={'A': object, 'B': object, 'C': np.float64}
quote_df.rename(columns={'A':'STK', 'B':'TOpen', 'C':'TPCLOSE', 'D':'TPrice', 'E':'THigh', 'F':'TLow', 'I':'TVol', 'J':'TAmt', 'e':'TDate', 'f':'TTime'}, inplace=True)
quote_df = quote_df.ix[:,[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31]]

这样做

columns = ['STK', 'TPrice', 'TPCLOSE', 'TOpen', 'THigh', 'TLow', 'TVol', 'TAmt', 'TDate', 'TTime']
df = pd.read_csv(StringIO(str_of_all), sep=',', usecols=[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31])
df.columns = columns

这将只读取您感兴趣的列,并正确地命名它们。不需要使用邪恶的.ix对象来做神奇的事情。

一般来说,SettingWithCopyWarning的目的是向用户(尤其是新用户)表明,他们可能正在对一个副本进行操作,而不是他们所认为的原始版本。有假阳性(低,如果你知道你在做什么,它可能是好的)。一种可能是像@Garrett建议的那样关闭警告(默认为warn)。

这是另一种选择:

In [1]: df = DataFrame(np.random.randn(5, 2), columns=list('AB'))

In [2]: dfa = df.ix[:, [1, 0]]

In [3]: dfa.is_copy
Out[3]: True

In [4]: dfa['A'] /= 2
/usr/local/bin/ipython:1: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_index,col_indexer] = value instead
  #!/usr/local/bin/python

你可以将is_copy标志设置为False,这将有效地关闭该对象的检查:

In [5]: dfa.is_copy = False

In [6]: dfa['A'] /= 2

如果显式复制,则不会发生进一步的警告:

In [7]: dfa = df.ix[:, [1, 0]].copy()

In [8]: dfa['A'] /= 2

上面OP显示的代码虽然是合法的,而且可能也是我所做的,但从技术上讲,它是这个警告的一个案例,而不是误报。另一种没有警告的方法是通过重新索引来执行选择操作,例如:

quote_df = quote_df.reindex(columns=['STK', ...])

Or,

quote_df = quote_df.reindex(['STK', ...], axis=1)  # v.0.21