Linux是一个内核，不是一个完整的操作系统。有不同的窗口系统和gui运行在Linux上提供窗口。通常X11是Linux发行版使用的窗口系统。

我想这个问题更像是“linux的原生GUI API是什么”。

在大多数情况下，X(又名X11)将用于http://en.wikipedia.org/wiki/X_Window_System。

您可以在这里找到API文档

GUI是功能的高级抽象，所以从XOrg服务器到OpenGL的几乎所有东西都是跨平台移植的，包括Windows平台。但如果你所说的GUI API是指*nix图形API，那么你可能会在“直接渲染基础设施”附近徘徊。

linux中最接近Win32的是libc，正如你所提到的，不仅是UI，还有事件和“其他操作系统的东西”

严格地说，Linux的API由它的系统调用组成。这些都是用户模式(非内核)程序可以调用的所有内核函数。这是一个非常低级的接口，允许程序做一些事情，比如打开和读取文件。有关一般介绍，请参阅http://en.wikipedia.org/wiki/System_call。

为了提供图形用户界面和其他特性，一个真正的Linux系统还会有一个运行在其上的其他软件的完整“堆栈”。这个堆栈的每个元素都将提供自己的API。

Linux是一个内核，不是一个完整的操作系统。有不同的窗口系统和gui运行在Linux上提供窗口。通常X11是Linux发行版使用的窗口系统。