XWindows可能是最接近所谓的“原生”:)

GUI是功能的高级抽象，所以从XOrg服务器到OpenGL的几乎所有东西都是跨平台移植的，包括Windows平台。但如果你所说的GUI API是指*nix图形API，那么你可能会在“直接渲染基础设施”附近徘徊。

XWindows可能是最接近所谓的“原生”:)

linux内核的图形化操作在/include/linux/fb.h中作为结构体fb_ops。最终，这就是X11、Wayland或DRM等附加组件所引用的内容。由于这些操作仅适用于视频卡，而不适用于矢量或光栅硬拷贝或面向tty的终端设备，因此它们作为GUI的用处是有限的;如果你不介意在必要时使用一些汇编器绕过系统调用，那么你需要这些附加组件来获得图形输出，这并不完全正确。

严格地说，Linux的API由它的系统调用组成。这些都是用户模式(非内核)程序可以调用的所有内核函数。这是一个非常低级的接口，允许程序做一些事情，比如打开和读取文件。有关一般介绍，请参阅http://en.wikipedia.org/wiki/System_call。

为了提供图形用户界面和其他特性，一个真正的Linux系统还会有一个运行在其上的其他软件的完整“堆栈”。这个堆栈的每个元素都将提供自己的API。

Wayland也值得一提，因为它通常被称为“未来的X11杀手”。

还要注意，Android和其他一些移动操作系统不包括X11，尽管它们有Linux内核，所以从这个意义上说，X11并不是所有Linux系统的本机。

跨平台与本土化没有任何关系。Cocoa也通过GNUStep移植到其他平台，但它仍然是OS X / macOS的原生版本。