我有两个数据帧df1和df2,其中df2是df1的子集。我如何得到一个新的数据帧(df3),这是两个数据帧之间的差异?

换句话说,一个在df1中所有的行/列都不在df2中的数据帧?


当前回答

通过使用drop_duplicate

pd.concat([df1,df2]).drop_duplicates(keep=False)

更新:

上面的方法只适用于那些本身没有副本的数据帧。例如:

df1=pd.DataFrame({'A':[1,2,3,3],'B':[2,3,4,4]})
df2=pd.DataFrame({'A':[1],'B':[2]})

它将输出如下所示,这是错误的

错误输出:

pd.concat([df1, df2]).drop_duplicates(keep=False)
Out[655]: 
   A  B
1  2  3

正确的输出

Out[656]: 
   A  B
1  2  3
2  3  4
3  3  4

如何实现这一目标?

方法一:将isin与tuple结合使用

df1[~df1.apply(tuple,1).isin(df2.apply(tuple,1))]
Out[657]: 
   A  B
1  2  3
2  3  4
3  3  4

方法二:与指标合并

df1.merge(df2,indicator = True, how='left').loc[lambda x : x['_merge']!='both']
Out[421]: 
   A  B     _merge
1  2  3  left_only
2  3  4  left_only
3  3  4  left_only

其他回答

对于行,尝试这样做,其中Name是联合索引列(可以是多个公共列的列表,或者指定left_on和right_on):

m = df1.merge(df2, on='Name', how='outer', suffixes=['', '_'], indicator=True)

indicator=True设置很有用,因为它添加了一个名为_merge的列,其中包含df1和df2之间的所有更改,分为3种可能的类型:“left_only”,“right_only”或“both”。

对于列,试试这个:

set(df1.columns).symmetric_difference(df2.columns)

方法1对于有nan的数据帧无效,因为pd.np.nan != pd.np.nan !我不确定这是否是最好的方法,但它可以避免

df1[~df1.astype(str).apply(tuple, 1).isin(df2.astype(str).apply(tuple, 1))]

它更慢,因为它需要将数据转换为字符串,但由于这个转换pd.np.nan == pd.np.nan。

让我们浏览一下代码。首先,我们将值转换为字符串,并将tuple函数应用于每一行。

df1.astype(str).apply(tuple, 1)
df2.astype(str).apply(tuple, 1)

多亏了这个,我们得到了pd。具有元组列表的系列对象。每个元组包含df1/df2的整行。 然后我们对df1应用isin方法来检查每个元组是否“在”df2中。 结果是pd。带有bool值的系列。如果tuple from df1在df2中,则为True。最后,我们用~符号对结果求反,并对df1进行滤波。长话短说,我们只能从df1中得到那些不在df2中的行。

为了使它更具可读性,我们可以这样写:

df1_str_tuples = df1.astype(str).apply(tuple, 1)
df2_str_tuples = df2.astype(str).apply(tuple, 1)
df1_values_in_df2_filter = df1_str_tuples.isin(df2_str_tuples)
df1_values_not_in_df2 = df1[~df1_values_in_df2_filter]

对称差分

如果你只对其中一个数据帧中的行感兴趣,而不是两个数据帧中的行,你在寻找集的差异:

pd.concat([df1,df2]).drop_duplicates(keep=False)

⚠️只有在两个数据帧都不包含任何重复的情况下才有效。

设置差分/关系代数差分

如果你对关系代数差异/集差异感兴趣,即df1-df2或df1\df2:

pd.concat([df1,df2,df2]).drop_duplicates(keep=False) 

⚠️只有在两个数据帧都不包含任何重复的情况下才有效。

正如这里提到的 那

df1[~df1.apply(tuple,1).isin(df2.apply(tuple,1))]

是正确的解决方案,但它会产生错误的输出如果

df1=pd.DataFrame({'A':[1],'B':[2]})
df2=pd.DataFrame({'A':[1,2,3,3],'B':[2,3,4,4]})

在这种情况下,上面的溶液会给出 空数据帧,相反,你应该使用concat方法后,从每个数据帧删除重复。

使用concate和drop_duplicate

df1=df1.drop_duplicates(keep="first") 
df2=df2.drop_duplicates(keep="first") 
pd.concat([df1,df2]).drop_duplicates(keep=False)

通过索引查找差异。假设df1是df2的一个子集,并且在进行子集设置时将索引前移

df1.loc[set(df1.index).symmetric_difference(set(df2.index))].dropna()

# Example

df1 = pd.DataFrame({"gender":np.random.choice(['m','f'],size=5), "subject":np.random.choice(["bio","phy","chem"],size=5)}, index = [1,2,3,4,5])

df2 =  df1.loc[[1,3,5]]

df1

 gender subject
1      f     bio
2      m    chem
3      f     phy
4      m     bio
5      f     bio

df2

  gender subject
1      f     bio
3      f     phy
5      f     bio

df3 = df1.loc[set(df1.index).symmetric_difference(set(df2.index))].dropna()

df3

  gender subject
2      m    chem
4      m     bio