我有两个数据帧df1和df2,其中df2是df1的子集。我如何得到一个新的数据帧(df3),这是两个数据帧之间的差异?

换句话说,一个在df1中所有的行/列都不在df2中的数据帧?


当前回答

我在处理副本时遇到了问题,当一边有副本,另一边至少有一个副本时,所以我使用了Counter。集合做一个更好的差异,确保双方有相同的计数。这不会返回副本,但如果双方有相同的计数,则不会返回任何副本。

from collections import Counter

def diff(df1, df2, on=None):
    """
    :param on: same as pandas.df.merge(on) (a list of columns)
    """
    on = on if on else df1.columns
    df1on = df1[on]
    df2on = df2[on]
    c1 = Counter(df1on.apply(tuple, 'columns'))
    c2 = Counter(df2on.apply(tuple, 'columns'))
    c1c2 = c1-c2
    c2c1 = c2-c1
    df1ondf2on = pd.DataFrame(list(c1c2.elements()), columns=on)
    df2ondf1on = pd.DataFrame(list(c2c1.elements()), columns=on)
    df1df2 = df1.merge(df1ondf2on).drop_duplicates(subset=on)
    df2df1 = df2.merge(df2ondf1on).drop_duplicates(subset=on)
    return pd.concat([df1df2, df2df1])
> df1 = pd.DataFrame({'a': [1, 1, 3, 4, 4]})
> df2 = pd.DataFrame({'a': [1, 2, 3, 4, 4]})
> diff(df1, df2)
   a
0  1
0  2

其他回答

对称差分

如果你只对其中一个数据帧中的行感兴趣,而不是两个数据帧中的行,你在寻找集的差异:

pd.concat([df1,df2]).drop_duplicates(keep=False)

⚠️只有在两个数据帧都不包含任何重复的情况下才有效。

设置差分/关系代数差分

如果你对关系代数差异/集差异感兴趣,即df1-df2或df1\df2:

pd.concat([df1,df2,df2]).drop_duplicates(keep=False) 

⚠️只有在两个数据帧都不包含任何重复的情况下才有效。

edit2,我想出了一个新的解决方案,不需要设置索引

newdf=pd.concat([df1,df2]).drop_duplicates(keep=False)

好吧,我发现最高投票的答案已经包含我已经弄明白了。是的,我们只能在每个dfs中没有重复的情况下使用此代码。


我有一个棘手的方法。首先,我们将“Name”设置为问题给出的两个数据框架的索引。由于我们在两个dfs中有相同的' Name ',我们可以从'大' df中删除'小' df的索引。 这是代码。

df1.set_index('Name',inplace=True)
df2.set_index('Name',inplace=True)
newdf=df1.drop(df2.index)

除了公认的答案,我想提出一个更广泛的解决方案,可以找到两个数据框架的2D集差异与任何索引/列(他们可能不符合两个数据框架)。此外,该方法允许设置浮动元素的容忍度,用于数据帧比较(它使用np.isclose)


import numpy as np
import pandas as pd

def get_dataframe_setdiff2d(df_new: pd.DataFrame, 
                            df_old: pd.DataFrame, 
                            rtol=1e-03, atol=1e-05) -> pd.DataFrame:
    """Returns set difference of two pandas DataFrames"""

    union_index = np.union1d(df_new.index, df_old.index)
    union_columns = np.union1d(df_new.columns, df_old.columns)

    new = df_new.reindex(index=union_index, columns=union_columns)
    old = df_old.reindex(index=union_index, columns=union_columns)

    mask_diff = ~np.isclose(new, old, rtol, atol)

    df_bool = pd.DataFrame(mask_diff, union_index, union_columns)

    df_diff = pd.concat([new[df_bool].stack(),
                         old[df_bool].stack()], axis=1)

    df_diff.columns = ["New", "Old"]

    return df_diff

例子:

In [1]

df1 = pd.DataFrame({'A':[2,1,2],'C':[2,1,2]})
df2 = pd.DataFrame({'A':[1,1],'B':[1,1]})

print("df1:\n", df1, "\n")

print("df2:\n", df2, "\n")

diff = get_dataframe_setdiff2d(df1, df2)

print("diff:\n", diff, "\n")
Out [1]

df1:
   A  C
0  2  2
1  1  1
2  2  2 

df2:
   A  B
0  1  1
1  1  1 

diff:
     New  Old
0 A  2.0  1.0
  B  NaN  1.0
  C  2.0  NaN
1 B  NaN  1.0
  C  1.0  NaN
2 A  2.0  NaN
  C  2.0  NaN 

通过索引查找差异。假设df1是df2的一个子集,并且在进行子集设置时将索引前移

df1.loc[set(df1.index).symmetric_difference(set(df2.index))].dropna()

# Example

df1 = pd.DataFrame({"gender":np.random.choice(['m','f'],size=5), "subject":np.random.choice(["bio","phy","chem"],size=5)}, index = [1,2,3,4,5])

df2 =  df1.loc[[1,3,5]]

df1

 gender subject
1      f     bio
2      m    chem
3      f     phy
4      m     bio
5      f     bio

df2

  gender subject
1      f     bio
3      f     phy
5      f     bio

df3 = df1.loc[set(df1.index).symmetric_difference(set(df2.index))].dropna()

df3

  gender subject
2      m    chem
4      m     bio

我发现deepdiff库是一个很棒的工具,如果需要不同的细节或排序问题,它也可以很好地扩展到数据框架。你可以尝试不同的to_dict('records'), to_numpy()和其他导出:

import pandas as pd
from deepdiff import DeepDiff

df1 = pd.DataFrame({
    'Name':
        ['John','Mike','Smith','Wale','Marry','Tom','Menda','Bolt','Yuswa'],
    'Age':
        [23,45,12,34,27,44,28,39,40]
})

df2 = df1[df1.Name.isin(['John','Smith','Wale','Tom','Menda','Yuswa'])]

DeepDiff(df1.to_dict(), df2.to_dict())
# {'dictionary_item_removed': [root['Name'][1], root['Name'][4], root['Name'][7], root['Age'][1], root['Age'][4], root['Age'][7]]}